| Processo: | 22/00562-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Iniciação Científica |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2022 |
| Data de Término da vigência: | 31 de dezembro de 2022 |
| Área de conhecimento: | Engenharias - Engenharia Química |
| Pesquisador responsável: | Pedro de Alcântara Pessôa Filho |
| Beneficiário: | Pedro Henrique Callil Soares |
| Instituição Sede: | Escola Politécnica (EP). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 14/21252-0 - Equilíbrio e processos de produção de biocombustíveis e bioprodutos, AP.TEM |
| Assunto(s): | Macromolécula Avaliação Simulação de dinâmica molecular Simulação de acoplamento molecular Estudo comparativo |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | docking molecular | simulação molecular | Simulação Molecular |
Resumo Docking molecular é uma técnica de simulação molecular que visa a predição da conformação e afinidade da ligação entre uma macromolécula (o receptor) e uma pequena molécula (o ligante), encontrando aplicações nas indústrias farmacêutica e alimentícia, entre outras.Em comparação com outras técnicas de simulação molecular, como a dinâmica molecular, é consideravelmente mais rápida, ao se utilizar de diversas simplificações. Entretanto, apresenta menor exatidão, já que apresenta menor fidelidade aos princípios físicos. Assim, devem ser tomados alguns cuidados para a escolha das simplificações adotadas (como a rigidez do receptor e ligante) e as moléculas em questão devem ser tratadas adequadamente (com a adição de cargas de maneira correta, protonação dos sítios ativos do receptor, adição ou deleção de átomos de hidrogênio, entre outros fatores). Além disso, o algoritmo utilizado pode vir a ter importância, então o software deve ser escolhido de maneira adequada.O projeto visa adotar pares receptor-ligante de um conjunto pré-definido, com conformações conhecidas, e fazer para cada par diversas simulações de docking, modificando os parâmetros e simplificações de cada simulação e verificando as diferenças encontradas nos resultados. | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |