Proteômica estrutural para a busca de alvos terapêuticos em câncer de boca

• Processo: 22/14348-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2023
• Situação: Interrompido
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Adriana Franco Paes Leme
• Beneficiário: Guilherme Araújo Câmara
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/18496-6 - O papel do álcool na transformação de células orais mediada por vesículas extracelulares, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/00104-8 - Explorando a proteômica de expansão para avaliar interações proteína-proteína, BE.EP.DR
• Assunto(s): Biologia estrutural Neoplasias bucais Espectrometria de massas Proteômica Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | Câncer de boca | Espectrometria de massas | Interactômica | proteômica | Câncer

Resumo

O tratamento para pacientes com carcinoma de células escamosas (CEC) representa um desafio clínico. Apesar dos avanços nas modalidades terapêuticas, as taxas de recorrência de CEC variam entre 18% a 76% em pacientes que recebem o tratamento padrão de cirurgia, radioterapia e/ou quimioterapia. Além disso, os pacientes com CEC apresentam uma baixa resposta a outras modalidades terapêuticas, como monoterapia contra EGFR e a imunoterapia. Em um estudo anterior (Carnielli et al., 2018), nosso grupo revelou a associação das proteínas CSTB, NDRG1 e PGK1 com o prognóstico de câncer de boca, sugerindo a hipótese de que essas proteínas podem estar envolvidas na progressão da doença. Portanto, o presente projeto propõe a aplicação de estratégias ortogonais de proteômica estrutural para a caracterização do interactoma dessas proteínas, afim de revelar os seus potenciais papeis na progressão do CEC. Para isso, a caracterização dos interactomas diferenciais dessas proteínas será realizada em queratinócitos normais (HMK) e transformados (SCC-25 e HSC3). As técnicas utilizadas para a caracterização destes interactomas serão a biotinilação dependente de proximidade e cofracionamento. Além disso, agentes de ligação cruzada serão empregados para a caracterização tridimensional das interfaces de interação. Este conjunto de métodos permitirá priorizar os complexos a serem modulados por peptídeos desenhados contra as interfaces de interação das proteínas, e os efeitos dessa modulação serão avaliados por experimentos funcionais. Por fim, a estratégia de proteólise limitada será empregada para a avaliação de alterações estruturais em complexos proteicos após o tratamento das linhagens celulares com os peptídeos, antecipando os efeitos deste tratamento no proteoma global.