Estudo por dinâmica molecular da interação entre as nitrosaminas e a proteína PAF-AH plasmática acoplada a membrana lipossomal

• Processo: 23/01973-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
• Data de Término da vigência: 22 de dezembro de 2023
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Marcos Hikari Toyama
• Beneficiário: Isabelly Annunciato
• Supervisor: Sergio Filipe Maia de Sousa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB-CLP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus Experimental do Litoral Paulista. São Vicente , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidade do Porto (UP), Portugal
• Vinculado à bolsa: 22/04772-7 - Avaliação da toxicidade hepática aguda e inflamação induzida por nitrosaminas em Mus musculus e Danio rerio, BP.MS
• Assunto(s): Função hepática Inflamação aguda Mus musculus Nitrosaminas Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Danio r | função hepática | inflamação aguda | Mus musculus | Nitrosaminas | Bioinformática

Resumo

As nitrosaminas são compostos classificados como contaminantes emergentes, carcinogênicos e oxidantes. Elas podem alterar as propriedades das membranas celulares e induzir um aumento dos lipídios biologicamente ativos, como o ácido araquidônico e o PAF, um potente agente pró-inflamatório capaz de induzir o aparecimento de doenças hepáticas e inflamatórias. A Lp-PLA2 (alternativamente conhecida como fator de ativação plaquetária-acetil-hidrolase - PAF-AH) é uma enzima que catalisa a hidrólise de PAF e pertence à superfamília PLA2, ela está associada estruturalmente a lipoproteína plasmática HDL. Como a Lp-PLA2 hidrolisa o PAF em sua forma inativa (lyso-PAF), os níveis de Lp-PLA2 são propostos para serem determinados por níveis in vivo de PAF, podendo, dessa forma, servir como marcadores de PAF. Por catabolizar o PAF, a Lp-PLA2 parece desempenhar um papel anti-inflamatório. Neste trabalho, usaremos duas nitrosaminas (N-Nitrosodietilamina e N-Nitrosodimetilamina) para realizar estudos de dinâmica molecular que serão realizados no laboratório BioSIM (Universidade do Porto) com o objetivo de avaliar a interação molecular destas nitrosaminas sobre a proteína Lp-PLA2, sobre a membrana lipídica e sobre a interface de interação da proteína Lp-PLA2. Essa avaliação bioquímica e biofísica, será realizada usando o software AMBER para identificar o comportamento estrutural da proteína e dos complexos acoplados. Estas simulações serão realizadas com a inserção das proteínas num modelo de bicamada lipídica heterogêneo, representativo da membrana plasmática humana, com uma distribuição adequada dos diferentes componentes lipídicos. (AU)