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Co-expressão de lncRNA correlacionados com características de interesse em modelo animal para doenças metabólicas em humanos

Processo: 23/14662-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2024
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2024
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Aline Silva Mello Cesar
Beneficiário:Lucas Echevarria Nascimento
Supervisor: Beatriz Gutierrez Gil
Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Universidad de León, Vegazana (ULE), Espanha  
Vinculado à bolsa:23/06442-7 - Co-expressão de lncRNA correlacionados com características de interesse em modelo animal para doenças metabólicas em humanos, BP.MS
Assunto(s):RNA longo não codificante   Genômica funcional
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:lipid | Liver | LncRNA | Nutrigenomic | Pig | Genômica funcional

Resumo

A nutrição desempenha um papel importante na saúde do indivíduo, pois influencia diretamente a expressão de genes específicos responsáveis por importantes vias metabólicas (RAMOS-LOPEZ et al., 2017). Segundo Bouchard e Ordovas (2012), a nutrigenômica evoluiu para incluir o estudo dos efeitos dos nutrientes na expressão gênica e eventos moleculares e biológicos relacionados, incorporando resultados importantes da transcriptômica, proteômica e metabolômica. A importância da utilização de suínos em estudos de nutrigenômica está na sua relevância no fornecimento de proteínas de alto valor nutricional e na economia mundial através da produção e consumo de sua carne. A carne suína desempenha um papel importante na dieta humana, sendo constituída por fontes proteicas de alto valor biológico e ácidos graxos essenciais como o ácido linoleico e o ácido linolênico (AG), fornecendo nutrientes que podem proporcionar às pessoas uma dieta segura, saudável e balanceada (PARK et al. ., 2012; DUGAN et al., 2015; MOGHADASIAN e SHAHIDI, 2017). No fígado, em estudo anterior realizado pelos integrantes do grupo, foi identificado o maior número de genes expressos diferencialmente (GDE), 281 e vias de sinalização relacionadas a doenças neurodegenerativas (FANALLI et al., 2022b). Entre os RNAs reguladores recentemente identificados estão os lncRNA (RNA não codificante longo) que são uma classe heterogênea de ncRNA (RNA não codificante) que possuem mais de 200 nucleotídeos, que estão envolvidos em diversos processos biológicos, incluindo desenvolvimento, diferenciação celular, respostas imunes, células ciclo e deposição de gordura subcutânea, regulando a expressão gênica. (HARROW et al., 2012; FATICA e BOZZONI, 2014; LIU et al., 2018). Assim, o objetivo deste projeto é realizar uma análise de co-expressão gênica de lncRNA e correlacionar os grupos de lncRNA co-expressos com características de interesse econômico e de saúde seguindo a metodologia proposta por Zhang e Horvath (2005) e Langfelder e Horvath ( 2008), WGCNA (Análise de Rede de Correlação Ponderada). Além disso, enquanto estiver na Universidade de León, o aluno participará de cursos de pós-graduação, clubes de jornal e reuniões de laboratório. (AU)

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