Apoio técnico aos projetos de genômica do CeTICS: sequenciamento e montagem de genomas ofídicos

• Processo: 24/14508-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo
• Beneficiário: Juan David Bayona Serrano
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, AP.CEPID
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica Sequenciamento de nova geração Serpentes Venenos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Genômica | Ngs | Serpentes | venenos | Genômica

Resumo

O CeTICS caminha para seu último ano de vigência. Os projetos envolvendoanálises genômicas e transcriptômicas de glândulas de veneno de serpentes e de outros animais produtores de veneno resultaram ao longo dos últimos 10 anos em um enorme volume de dados de sequências que carecem de curadoria e organização. Esse conjunto se complementa com outro enorme volume de dados gerados no Projeto Temático 2016/50127-5. Alguns desses dados, especialmente as cerca de duas dezenas de genomas de serpentes sequenciados ou em processo de sequenciamento, ainda devem passar por etapas de análises do dado bruto até a montagem e anotação dos genomas. Recentemente, adquirimos pelo CeTICS um sequenciador de moléculas longas (Oxford Nanopore PromethIon) que permitirá a geração de novos genomas e transcriptomas com maior completude. Há necessidade, portanto, da integraçãodesses dados para que sejam perpetuados e utilizados em projetos futuros do grupo ou por usuários externos. Nesse sentido, propomos para essa bolsa a contratação de um bolsista que possa ser treinado tanto nas etapas de sequenciamento na nova plataforma como na execução das etapas analíticas bioinformáticas associadas a montagem de genomas e transcriptomas.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TORRES-BONILLA, KRISTIAN A.; BAYONA-SERRANO, JUAN D.; SAENZ-SUAREZ, PAULA A.; ZAMBRANO, DUVAN F.; BERNAL-BAUTISTA, MANUEL H.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INACIO L. M.; HYSLOP, STEPHEN. Biochemical and proteomic profiling reveals potent proteolytic activity in the venom of Erythrolamprus melanotus (Shaw's dark ground snake, Xenodontini). Biochimie, v. 235, p. 12-pg., 2025-08-01. (24/14508-0, 13/07467-1, 16/50127-5, 17/24498-9)