Desenvolvendo um protocolo para manipular a biota do solo em microcosmos experimentais

• Processo: 24/07113-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Fernando Dini Andreote
• Beneficiário: Felipe Martins do Rêgo Barros
• Supervisor: Andre Luiz Custodio Franco
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Indiana University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 23/04352-0 - Interação entre as comunidades de nematoides e bactérias e sua relação com as emissões de gases do efeito estufa em sistemas integrados de produção agropecuária no Brasil, BP.PD
• Assunto(s): RNA ribossômico 16S Ecologia do solo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Internal Transcribed Spacer | microbial community structure | nematode community | soil defaunation | 16S rRNA | Ecologia do solo

Resumo

Os nematoides são uma fração importante da comunidade faunística do solo, que tem sido amplamente explorada em estudos ecológicos com o objetivo de avaliar a relação entre a diversidade abaixo do solo e as principais funções dos ecossistemas terrestres. Esses estudos têm utilizado métodos para manipular a fauna que geralmente alteram as características físicas, químicas e biológicas do solo e não representam a complexidade biótica e abiótica do ambiente em seu estado natural. Neste projeto de pesquisa, nosso objetivo foi desenvolver um método eficaz para excluir a fauna de amostras de solo não deformado que não cause mudanças significativas nas comunidades microbianas do solo. Para isso, será realizado um experimento em laboratório, empregando um delineamento inteiramente casualizado para avaliar três tratamentos: (i) ciclos de aquecimento/resfriamento (12 horas a 65°C, seguidas de 24 horas a -20°C e, em seguida, 12 horas a 65°C novamente); (ii) aquecimento por 48 horas a 65°C; e (iii) controle (amostras mantidas a 4°C), aplicados a amostras de solo com sua estrutura física preservada em três volumes diferentes: 100, 500 e 100 cm3. As amostras de solo serão coletadas na propriedade Griffy Woods da Indiana University Research and Teaching Preserve no Condado de Monroe, Indiana, EUA. Ao final do experimento, os nematoides serão contados e identificados usando um microscópio invertido, e os primeiros 150 nematoides por amostra serão classificados em cinco grupos tróficos diferentes: bacteriófagos, fungívoros, herbívoros, onívoros e predadores. Além disso, a composição, estrutura e diversidade das comunidades bacterianas e fúngicas do solo serão analisadas por meio do sequenciamento do 16S rRNA e do ITS, respectivamente. Os resultados serão submetidos à análise de componente principal, e as diferenças entre os tratamentos serão avaliadas pela análise PERMANOVA. A abundância relativa de bactérias e fungos será submetida ao teste t de Welch bilateral, e a densidade populacional dos grupos alimentares de nematoides será submetida à análise de variância não paramétrica de Kruskal-Wallis. Com este estudo será possível estabelecer um método de desfaunização confiável que não cause mudanças significativas na comunidade microbiana do solo, permitindo seu uso em estudos de ecologia microbiana.