Explorando a proteômica de expansão para avaliar interações proteína-proteína

• Processo: 25/00104-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 31 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de março de 2026
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Adriana Franco Paes Leme
• Beneficiário: Guilherme Araújo Câmara
• Supervisor: Kiryl D Piatkevich
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Westlake University, China
• Vinculado à bolsa: 22/14348-8 - Proteômica estrutural para a busca de alvos terapêuticos em câncer de boca, BP.DR
• Assunto(s): Neoplasias bucais Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Expansion Proteomics | Interactomics | oral cancer | oral squamous cell carcinoma | Proximity Labeling | Spatial Proteomics | Câncer

Resumo

O carcinoma de células escamosas (CEC) é um subtipo prevalente de câncer oral que corresponde à aproximadamente 90% dos casos mundiais. A taxa de sobrevida em 5 anos de pacientes diagnosticados em estágios mais avançados da doença (estágio III ou IV) é de aproximadamente 20%, tornando evidente que a descoberta de marcadores de diagnóstico ou prognóstico é essencial para melhorar os resultados para o paciente, visto que um rápido diagnóstico e tratamento é crucial para um melhor desfecho para o paciente. Nosso grupo demonstrou que a desregulação espacial da abundância das proteínas N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1), cystatin B (CSTB) and phosphoglycerate kinase 1 (PGK1) em ilhas neoplásicas da fronte invasivo tumoral de CEC está associada a um pior prognóstico. Entretanto, pouco se sabe sobre o papel dessas proteínas no desenvolvimento de CEC. No presente projeto, propomos o desenvolvimento de uma estratégia inovadora baseada em immunoproximity labeling associado à proteômica de expansão para a caracterização dos interactomas de CSTB, NDRG1 e PGK1 com uma resolução espacial à nível de célula única. Para isso, os interactomas dessas proteínas-alvo serão comparados em duas regiões de tecido fixado em parafina (FFPE) de CEC: o fronte invasivo tumoral e o interior do tumor. Acreditamos que essa estratégia inédita irá ressaltar interações proteína-proteína que são moduladas em subregiões do tecido de diferentes níveis de agressividade. Em conjunto, os resultados esperados possibilitarão a identificação de proteínas com potencial valor terapêutico, que por sua vez, facilitarão a proposta de intervenções que favoreçam o melhor prognóstico de pacientes de CEC.