CARACTERIZAÇÃO DE RNAs NÃO CODIFICADORES LONGOS ASSOCIADOS AO FENÓTIPO TRONCO-TUMORAL EM ADENOCARCINOMA DUCTAL PANCREÁTICO

• Processo: 24/21592-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Daniela Sanchez Basseres
• Beneficiário: Nicolas Paulino Rezende
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Oncologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epigenetic regulation | Long Non-Coding RNAs (LncRNAs) | metastasis | Pdac | Prognostic Biomarkers | Tumor Stem Cell Phenotype | Oncologia

Resumo

O adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC), que representa mais de 90% das neoplasias pancreáticas, é um câncer altamente letal, com taxa de sobrevida de 5 anos inferior a 10%. Isso se deve à agressiva disseminação metastática. Um fator crítico para a metástase é o fenótipo tronco-tumoral, mediado pelas células tronco-tumorais (CTTs), responsáveis pela manutenção tumoral, quimiorresistência e metástase. Contudo, os mecanismos moleculares que sustentam o fenótipo tronco-tumoral das CTTs pancreáticas ainda são pouco compreendidos, limitando avanços terapêuticos. Como esse processo é predominantemente epigenético, nosso grupo propôs que RNAs não codificadores longos (lncRNAs) desempenham papel relevante. Utilizamos dados públicos de RNAseq de pacientes com PDAC (The Cancer Genome Atlas, TCGA) para calcular o índice de pluripotência (mRNAsi, do inglês mRNA stemness index) e identificar lncRNAs diferencialmente expressos em pacientes com altos e baixos índices de pluripotência. Este projeto visa: (1) validar a expressão diferencial dos lncRNAs em modelos celulares de CTTs de PDAC in vitro; (2) avaliar o valor prognóstico dos lncRNAs utilizando dados do International Cancer Genome Consortium (ICGC) e TCGA; e (3) investigar o enriquecimento desses lncRNAs em tumores pancreáticos comparados ao tecido normal adjacente usando RNAseq de tecido (Bulk) e de células únicas. Esperamos validar lncRNAs com potencial prognóstico em CTTs de PDAC, estabelecendo a base para seu estudo funcional e possível desenvolvimento como alvos terapêuticos. (AU)