Análise do circuito funcional dos miR-372/373 com HIF1A na infecção por Leishmania infantum

• Processo: 25/10345-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia
• Pesquisador responsável: Sandra Marcia Muxel
• Beneficiário: Bruno Prado Eleuterio
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 24/08802-3 - Estudo integrativo de Long noncoding RNAs e microRNAs na infecção por Leishmania, AP.R
• Assunto(s): Leishmania Macrófagos MicroRNAs Transcriptoma Interações hospedeiro-parasita
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Hif | leishmania | Macrófago | microRNA | Transcriptoma | Interação Parasita-hospedeiro

Resumo

Neste projeto, utilizaremos um pipeline de análise transcriptômica baseado em ferramentas de bioinformática para investigar a regulação de HIF1A por miR-372 e miR-373 em macrófagos infectados com Leishmania infantum. Nosso objetivo é analisar perfil transcricional de macrófagos infectados e controles e com inibição de miR-372/373. Utilizaremos análises de sequenciamento de RNA (RNA-Seq), qPCR e citometria de fluxo para identificar variações na expressão gênica e microRNA, além de técnicas de bioinformática para predizer as interações entre miRNAs e seu targeting nos principais mRNAs, incluindo análises de complementaridade de seed e validação in silico. Além disso, faremos análises de enriquecimento funcional (Gene Ontology, KEGG) para compreender os processos envolvidos, e geração de redes de interação gênica com ferramentas como Cytoscape. Essa abordagem permite integrar dados de expressão gênica e miRNA para entender como a regulação pós-transcricional impacta na via de HIF-1¿, metabolismo glicolítico, inflamação e resposta imune ao parasita. A integração de dados de expressão, além de anotações funcionais e redes de interação de genes e proteínas, permitirá investigar os efeitos moduladores de miR-372/373 sobre HIF1A e suas vias relacionadas, contribuindo para entender como L. infantum interfere na resposta imune por meio de redes regulatórias controladas por microRNAs. (AU)