Validação do método otimizado de extração de DNA em Amostras FFPE para análises epigenômicas.

• Processo: 25/07128-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Leslie Domenici Kulikowski
• Beneficiário: Karina Marinho Nascimento
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Extração de DNA Neoplasias Biologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Extracao de DNA | Ffpe | tumor | Biologia Molecular

Resumo

O uso de amostras FFPE para análises moleculares tem se intensificado ao longo dos anos, especialmente para a pesquisa e diagnóstico clínico de tumores. Essa técnica é crucial para a compreensão de estruturas genômicas complexas e para a identificação de causas genéticas de doenças. Para isso, a qualidade do DNA extraído dessas amostras precisa ser íntegra e consistente, o que não acontece devido ao processo de fixação do tecido. Isto posto, o presente projeto visa aperfeiçoar técnicas de extração de DNA de amostras biológicas fixadas em formalina e incluídas em parafina, especialmente visando material biopsiado de tumores. O DNA extraído será avaliado quanto a sua qualidade (quantidade e pureza) e integridade antes de ser submetido a experimentos de biologia molecular para análises epigenômicas. Além disso, os dados brutos provenientes desses ensaios serão avaliados nos parâmetros de controle de qualidade. Essa otimização tem potencial de aumentar a qualidade dos diagnósticos e diminuir o custo do ensaio de metilação por plataformas de array, permitindo avanços significativos no acesso ao prognóstico dos pacientes, na compreensão e tratamento de doenças genéticas e neoplasias.