Identificação de proteínas que interagem com a proteína humana AUF1 que se liga e degrada mRNA

• Processo: 00/11035-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Alexandre José Christino Quaresma
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 98/05891-9 - Expressão, purificação e cristalização da proteína HBx do vírus da Hepatite B para sua análise estrutural por difração de raios X, AP.JP
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica Interação proteína-proteína Degradação de proteínas RNA mensageiro
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Auf1 | Degradacao De Rmna | Interacao De Proteinas | Reciclagem De Mrna | Regulacao Genica | Yeast 2-Hybrid System

Resumo

Os mRNAs de certos proto-oncogenes e citocinas freqüentemente contém um domínio rico em AU localizado na região 3' não traduzida e são rapidamente reciclados. A proteína AUF1 é um dos primeiros fatores caracterizados que se liga à região rica em AU desses mRNAs instáveis. Dados experimentais mostram que a ligação da AUF1 à região rica em AU confere instabilidade ao mRNA tanto in vivo quanto in vitro. A proteína AUF1 é expressa em quatro diferentes isoformas: p37, p40, p42, p45, todas quais se localizam tanto no citoplasma quanto no núcleo. As quatro isoformas apresentam duas regiões centrais com 90 aminoácidos cada, denominadas RRMs ("RNA recognition motifs"), que fazem o contato com o mRNA. Além disso, a AUF1 apresenta extensas regiões - N- e C- terminais - de funções ainda não muito conhecidas. Interessantemente as quatro isoformas variam entre si nestas regiões N- e C-terminais. Mesmo que a AUF1 não degrade o mRNA direto, acredita-se que as suas regiões N- e C- terminal possam estar envolvidas na ligação a outras proteínas ou ao transporte de um complexo AUF1-mRNA em compartimentos celulares distintos. O objetivo deste trabalho é identificar proteínas que interagem com a AUF1 usando o "Yeast 2-hybrid system" para melhor compreender a função da proteína AUF1 no contexto da degradação de mRNA. (AU)