Análises estruturais, funcionais e evolutivas de helitrons em cana-de-açúcar

• Processo: 09/51632-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Nathalia de Setta Costa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/52074-0 - Sugarcane genome sequence: plant transposable elements are active contributors to gene structure variation, regulation and function, AP.BIOEN.TEM
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Saccharum Elementos de DNA transponíveis Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Elementos De Transposicao | Evolucao Genomica | Helitrons | Saccharum Spp. | Variablidade Genetica

Resumo

A cana-de-açúcar é uma cultura de extrema importância no cenário econômico brasileiro, devido à produção do bioetanol e do açúcar. Dessa forma, o estudo da genética dessa planta tem se tornado atrativo, pois visa contribuir no esclarecimento dos mecanismos que geram variabilidade genética. Estes estudos podem permitir a seleção de genótipos que resultem em aumento da produtividade e melhoramento de características agronomicamente importantes. Dos fatores que geram variabilidade em plantas, pode-se destacar os elementos de transposição, que geram rearranjos, duplicações e variabilidade na produção de proteínas. Neste contexto, este projeto de pesquisa integra um Projeto Temático, e tem como objetivo central o estudo de um grupo específico de elementos que ainda não foram estudados em cana, os helitrons, já relacionados à geração de variabilidade em outras gramíneas, como o arroz e o milho. As análises consistirão da caracterização de helitrons e de regiões genômicas que os contenham, da produção de seus perfis de expressão em diferentes variedades de cana, com fenótipos de interesse no melhoramento e, da sua identificação em espécies relacionadas, por meio de uma abordagem evolutiva. Assim, espera-se que os resultados produzidos contribuam com o entendimento do papel dos helitrons na dinâmica do genoma da cana-de-açúcar, como também forneçam ferramentas de estudo e experimentação de cultivares. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; DE SETTA, NATHALIA; CRUZ, EDGAR A. O.; VIEIRA, ANDREIA PRATA; MEDINA, ROSARIO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. PLoS One, v. 9, n. 5, MAY 21 2014. (09/51632-1, 08/52074-0, 09/09217-7, 12/14610-2, 08/58243-8, 12/02671-7)

DIAS, HENRIQUE MOURA; VIEIRA, ANDREIA PRATA; DE JESUS, ERIKA MARIA; DE SETTA, NATHALIA; BARROS, GESIELE; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Functional and comparative analysis of THI1 gene in grasses with a focus on sugarcane. PeerJ, v. 11, p. 27-pg., 2023-05-15. (08/52074-0, 15/05058-2, 16/17545-8, 19/08239-9, 09/51632-1)

DE SETTA, NATHALIA; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS; METCALFE, CUSHLA JANE; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELO; DEL BEM, LUIZ EDUARDO; VICENTINI, RENATO; SILVEIRA NOGUEIRA, FABIO TEBALDI; CAMPOS, ROBERTA ALVARES; NUNES, SIDENY LIMA; GASPERAZZO TURRINI, PAULA CRISTINA; et al. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC Genomics, v. 15, JUN 30 2014. (09/51632-1, 10/05591-9, 08/54201-9, 09/09116-6, 11/05317-7, 08/52074-0, 09/09217-7, 08/58031-0, 08/52197-4, 08/58243-8, 08/52146-0)