Estudo da seletividade e afinidade de ligantes naturais e sintéticos ao receptor de hormônio tireoidiano por cálculos de energia livre

• Processo: 06/01977-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2006
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica
• Pesquisador responsável: Igor Polikarpov
• Beneficiário: Alexandre Suman de Araujo
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dinamica Molecular | Energia Livre | Simulacoes Computacionais | Dinâmica Molecular

Resumo

O projeto tem como objetivo realizar um estudo da afinidade e seletividade de ligantes naturais e sintéticos do Receptor de Hormônio Tireoidiano (TR, para Thyroidian Hormone Receptor) a partir de cálculos de energia livre obtidos de simulações de Dinâmica Molecular. Utilizaremos o método semiempírico LIE (Linear Interaction Energy) e inicialmente faremos uma calibração dos parâmetros utilizados no método para um conjunto de ligantes, de modo que os valores de energias livres calculados e experimentais coincidam. Com esses parâmetros definidos, realizaremos simulações com outro conjunto de ligantes e compararemos os resultados obtidos com valores experimentais. A partir dos resultados dos cálculos de energia livre e da análise das interações microscópicas ligante-receptor, esperamos entender melhor as características químicas e estruturais que determinam a seletividade e afinidade dos diversos ligantes às diferentes isoformas do TR. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE ARAUJO, ALEXANDRE SUMAN; MARTINEZ, LEANDRO; NICOLUCI, RICARDO DE PAULA; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Structural modeling of high-affinity thyroid receptor-ligand complexes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 39, n. 11, p. 1523-1536, OCT 2010. (06/06831-8, 06/01977-4, 06/00182-8)