Estudo da seletividade e afinidade de ligantes naturais e sintéticos ao receptor de hormônio tireoidiano por cálculos de energia livre

Resumo

O projeto tem como objetivo realizar um estudo da afinidade e seletividade de ligantes naturais e sintéticos do Receptor de Hormônio Tireoidiano (TR, para Thyroidian Hormone Receptor) a partir de cálculos de energia livre obtidos de simulações de Dinâmica Molecular. Utilizaremos o método semiempírico LIE (Linear Interaction Energy) e inicialmente faremos uma calibração dos parâmetros utilizados no método para um conjunto de ligantes, de modo que os valores de energias livres calculados e experimentais coincidam. Com esses parâmetros definidos, realizaremos simulações com outro conjunto de ligantes e compararemos os resultados obtidos com valores experimentais. A partir dos resultados dos cálculos de energia livre e da análise das interações microscópicas ligante-receptor, esperamos entender melhor as características químicas e estruturais que determinam a seletividade e afinidade dos diversos ligantes às diferentes isoformas do TR. (AU)