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Criacao e utilizacao de ferramentas computacionais para suporte de projetos de sequenciamento de dna em larga escala.

Processo: 98/13423-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 1998
Data de Término da vigência: 31 de maio de 1999
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:Renato Fonseca Furquim Werneck
Instituição Sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Biologia molecular
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bioinformatica | Biologia Computacional | Biologia Molecular | Projeto De | Sequeciamento De Genomas

Resumo

O bolsista auxiliará na resolução dos diversos problemas algorítmicos e computacionais encontrados pelo Laboratório de Bioinformática do IC-UNICAMP. Entre eles podem-se citar: montagem de fragmentos de DNA, integração entre mapeamento e montagem, e análise comparativa de genomas. Esses e outros problemas tem que ser resolvidos como parte do suporte que o LBI tem dado ao projeto de sequenciamento da bactéria Xylella fastidiosa (projeto GENOMA/FAPESP). A atividade do bolsista será diversificada, incluindo tanto a criação de programas novos quanto a utilização de programas já prontos. (AU)

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