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Analise da diversidade microbiana em regioes preservados de mata atlantica e de cerrado.

Processo: 07/53413-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2007
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2009
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Otavio Henrique Thiemann
Beneficiário:Victor Emanoel Armini Caldas
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia   Metagenoma   Cerrado   Mata Atlântica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cerrado | Filogenia | Mata Atlantica | Metagenoma | Microbiologia Aplicada | Rdna 16S

Resumo

Os métodos tradicionais de isolamento e cultura são limitados para o estudo dos microrganismos de amostras ambientais devido ao caráter restritivo dos meios de cultura. Estima-se que 99% da biodiversidade do solo permaneça desconhecida. Entretanto, métodos moleculares têm permitido analisar as informações gênicas a respeito de microorganismos. Este trabalho visa objetivo obter informações sobre biodiversidade e relações filogenéticas dos microorganismos presentes em amostras de solos de regiões conservadas de dois ecossistemas brasileiros: a Mata Atlântica e o Cerrado. A biodiversidade microbiana nestes dois ecossistemas será investigada por meio da amplificação do ONA ambiental extraído das amostras utilizando oligonucleotídeos do gene 16S rONA Os produtos gênicos amplificados serão clonados em vetor de propagação e transformados em E. coli para construção de bibliotecas ambientais. Dados obtidos anteriormente por DGGE mostraram que as amostras da Mata Atlântica e do Cerrado apresentam maior diversidade estimada entre as diferentes amostras investigadas por nós, justificando os solos escolhidos. Uma biblioteca metagênomica de amostras do solo da Mata com 150 clones foi construída utilizando o fragmento gênico de 1500 Kb amplificado a partir do par de oligonucleotídeos pA e pc5B. O seqüenciamento e análise do gene 16S rONA da Biblioteca destas amostras permitirão inferências fílogenéticas acerca da biodiversidade e fornecerão dados críticos acerca da correlação entre esses dois importantes ecossistemas. (AU)

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