Identificação de componentes envolvidos na fosforilação reversível de proteínas no genoma da cana-de-açúcar

• Processo: 01/06922-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Aline Maria da Silva
• Beneficiário: Ana Carolina Quirino Simoes
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Transdução de sinais Fosforilação Cana-de-açúcar Genomas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Cana De Acucar | Data Mining | Fosforilacao De Proteinas | Transducao De Sinal

Resumo

Neste projeto pretendemos identificar e analisar os componentes envolvidos na fosforilação reversível de proteínas presentes no banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) de cana de açúcar. Este banco contém mais de 250.000 seqüências das extremidades 5' e 3's de de cDNAs da cana de açúcar e é resultado do projeto SUCEST (Sugar Cane ESTs) patrocinado pela FAPESP. cDNAs codificadores de proteínas quinases, proteínas fosfatases além de outras proteínas que modulam a fosforilação reversível serão identificados e comparados com genes de outros organismos, principalmente plantas, com o objetivo, de estabelecermos um catálogo destes genes para a cana de açúcar. Quando possível os cDNAs identificados serão associados a vias de transdução de sinal conhecidas que regulam diferentes processos celulares. Pretendemos realizar uma estimativa da abundância destes cDNAs (ESTs) nos diferentes tecidos da planta e também do número de genes alelos e/ou parálogos. Estes objetivos são parte do projeto de data mining intitulado "Identificação dos componentes de transdução de sinal do genoma da cana de açúcar" coordenado pelas Profas. Gláucia Mendes Souza e Aline Maria da Silva (auxílio FAPESP 00/07425-7). (AU)