Bioinformática para anotação do genoma do fitopatógeno (Leifsonia xyli - subsp. xyli)

• Processo: 01/01122-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biologia Geral
• Pesquisador responsável: Joao Paulo Fumio Whitaker Kitajima
• Beneficiário: Anderson Belgamo
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Projeto genoma Fitopatógenos Leifsonia xyli Anotação de sequência molecular Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anotacao | Bioinformatica | Cana-De-Acucar | Fitopatogeno | Leifsonia Xyli Subsp.Xyli | Projeto Genoma

Resumo

Este projeto consiste em instalar e manter um sistema local de informações para os dados de anotação do genoma da bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli, fitopatógeno da cana-de-açúcar. A partir de um pacote mínimo já disponível no LBI (Laboratório de Bioinformática/IC/UNICAMP), o bolsista acompanhará a finalização da montagem do genoma (estimado em cerca de 3.000.000 pares de bases) e também a anotação do mesmo. Tudo isto será disponibilizado em um website do genoma no Departamento de Fitopatologia da ESALQ. A parte de sequenciamento será realizado pelos participantes do programa AEG (Agrionomical and Environmental Genomes). (AU)