Bioinformática para estudos genômicos

• Processo: 99/11876-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 07 de agosto de 2000
• Data de Término da vigência: 06 de agosto de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: João Carlos Setubal
• Pesquisador Anfitrião: Phil Green
• Instituição Sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Washington, Estados Unidos
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica comparativa Estudos de associação genética Genomas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Biologia Computacional | Genomica Comparativa | Identificacao De Genes | Montagem De Dna | Projetos Genoma

Resumo

O projeto visa fundamentalmente ao aperfeiçoamento do candidato na área de bioinformática para estudos genômicos através de trabalho conjunto com um pesquisador de renome mundial. Este aperfeiçoamento servirá para fortalecer a competência do Laboratório de Bioinformática do Instituto de Computação da Unicamp. Em particular pretende-se desenvolver ferramentas computacionais que deverão ser úteis para os projetos genoma financiados pela FAPESP. O trabalho previsto inclui os seguintes tópicos: 1) Algoritmo e programa para criação de um "scaffold" de auxílio à montagem de um genoma. 2) Ferramenta para comparação detalhada de dois genomas bacterianos completos. 3) Identificação de seqüências codificadoras de genes humanos com base em ESTs e no genoma completo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

WOOD‚ D.W.; SETUBAL‚ J.C.; KAUL‚ R.; MONKS‚ D.E.; KITAJIMA‚ J.P.; OKURA‚ V.K.; ZHOU‚ Y.; CHEN‚ L.; WOOD‚ G.E.; ALMEIDA JR‚ N.F.; et al. The genome of the natural genetic engineer Agrobacterium tumefaciens C58. Science, v. 294, n. 5550, p. 2317-2323, 2001. (99/11876-5)