Estudo da expressao diferencial para identificacao e caracterizacao de genes envolvidos na progressao tumoral em melanoma.

• Processo: 01/07164-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2005
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Enilza Maria Espreafico
• Beneficiário: Josane de Freitas Sousa
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Metástase Biologia computacional Expressão gênica diferencial Técnica ORESTES Melanoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Expressao Diferencial | Melanoma | Metastase | Orestes | Rearranjos Cromossomicos

Resumo

O presente projeto tem o objetivo de identificar e realizar a caracterização funcional de genes envolvidos na progressão tumoral. Utilizaremos como modelo experimental, uma coleção de linhagens celulares de diferentes estágios da progressão tumoral de melanoma humano e uma coleção de linhagens híbridas de melanoma de camundongo e macrófago humano, que apresentam diferentes potenciais metastáticos. A primeira etapa do trabalho consistirá em selecionar, in silico, clones ORESTES gerados pelo Projeto Genoma Humano do Câncer, do qual participamos que alinhem em regiões cromossômicas cujos rearranjos são freqüentemente associados com melanoma ou que sejam freqüentes em vários tipos de neoplasias ou ainda ORESTES que alinhem em cromossomos humanos incorporados pelas linhagens híbridas. Os clones ORESTES selecionados serão utilizados na construção de "macroarrays" ou "microarrays" para hibridação contra cDNA marcado das diferentes linhagens celulares. Serão também gerados "arrays" a partir de bibliotecas de subtração entre linhagens de crescimento radial e metastático. Após a seleção de genes candidatos, cujo padrão de expressão, confirmado em Northern blot, indique um potencial envolvimento na progressão tumoral, iniciaremos testes funcionais para determinar o efeito da super-expressão ou supressão da expressão destes genes sobre o fenótipo metastático. (AU)