Caracterização das transcriptomas do fungo Trichoderma reesei através da análise seriada da expressão gênica (SAGE)

• Processo: 02/04908-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Hamza Fahmi Ali El-Dorry
• Beneficiário: Erik Cendel Saenz Tejada
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 97/05267-0 - A sinalização da expressão gênica em eucariotos por carboidrato: celulose e glicose e seus papéis na expressão do sistema celulolítico em microrganismos, AP.TEM
• Assunto(s): Análise serial da expressão gênica (SAGE) Trichoderma reesei
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aminoacidos | Glicose | Oxigenio | Sage | Sequenciamento

Resumo

A evolução tem produzido diversas vias metabólicas e mecanismos regulatórios que refletem a adaptação de uma imensa variedade de microrganismos frente a diferentes ambientes e necessidades nutricionais. O estudo da expressão gênica global em nível transcricional é importante para que se possa analisar as alterações metabólicas necessárias para acompanhar os processos biológicos distantes, bem como entender o controle da regulação das vias metabólicas entre os diferentes organismos. Neste estudo usaremos como sistema modelo um microrganismo multicelular, o fungo filamentoso Trichoderma reesei. T. reesei é um microrganismo que vem sendo utilizado por vários laboratórios em todo o mundo para o estudo dos diversos processos biológicos básicos, devido à sua grande importância biotecnológica. Recentemente, estabelecemos um banco de dados de ESTs (Expressed Sequence Tags) para, este microrganismo e, através da técnica de "cDNA microarray", determinamos o controle metabólico da rede da glicólise, do ciclo de TCA e o "pyruvate bypass". Gostaríamos de complementar aquela iniciativa através da análise da expressão gênica global, utilizando a técnica de SAGE, de tal forma que possamos analisar o controle metabólico em resposta às seguintes condições metabólicas: variações na disponibilidade de glicose, de aminoácidos e de oxigênio. Tal estudo é necessário para o entendimento, em nível transcricional, do controle da rede metabólica desse microrganismo multicelular. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

TEJADA, Erik Cendel Saenz. Caracterização do gene do Fator Transcricional 3 da RNA Polimerase B (btf3) de Trichoderma reesei e o efeito de seu nocaute sobre a expressão gênica no estresse por choque térmico. 2007. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.