Identificação de sistemas dinâmicos de reticulados

• Processo: 01/14115-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2002
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Matemática da Computação
• Pesquisador responsável: Junior Barrera
• Beneficiário: Nestor Walter Trepode
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Simulação por computador Expressão gênica Processos estocásticos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Estimacao | Simulacao | Sistema Dinamico | Sistemas Estocasticos

Resumo

O presente projeto refere-se à simulação e identificação de Sistemas Dinâmicos Finitos ou FDS ("Finite Dynamical Systems"), que constituem um modelo adequado para a representação de redes de expressão gênica. Mediante o uso de técnicas de otimização estatística se efetua a identificação, a partir de amostras de dinâmicas do sistema ideal. Simulando o sistema identificado e comparando o seu comportamento com amostras do sistema ideal são avaliados os resultados obtidos. A identificação de sistemas divide-se em duas etapas: I - reconhecimento da arquitetura: II - aprendizado da função de transição de estados. Ambos os aspectos serão considerados nos nossos estudos. Para lidar com amostras pequenas se efetuará a identificação com restrições da dinâmica de FDSs, estudando e desenvolvendo os aspectos teóricos e algoritmos necessários. Posteriormente, se realizará a identificação de sistemas estocásticos que representam mais adequadamente os sistemas reais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TREPODE, NESTOR WALTER; ARMELIN, HUGO AGUIRRE; BITTNER, MICHAEL; BARRERA, JUNIOR; GUBITOSO, MARCO DIMAS; HASHIMOTO, RONALDO FUMIO. A Robust Structural PGN Model for Control of Cell-Cycle Progression Stabilized by Negative Feedbacks. EURASIP JOURNAL ON BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY, v. N/A, n. 1, p. 11-pg., 2007-12-01. (03/02717-8, 01/14115-7, 05/00587-5)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

TREPODE, Nestor Walter. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas.. 2007. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI) São Paulo.