Procura de genes de integrina em Trypanosoma cruzi por genômica comparativa

• Processo: 03/05317-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2004
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marcelo Ribeiro da Silva Briones
• Beneficiário: Silvia Yukie Kawashita
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica comparativa Trypanosoma cruzi Integrinas Adesão celular Doença de Chagas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Adesao Celular | Doenca De Chagas | Genomica Comparativa | Integrinas | Trypanosoma Cruzi

Resumo

As integrinas pertencem a uma superfamília de proteínas de adesão e transdução de sinal, muito bem caracterizadas em vertebrados e presentes em invertebrados, fungos (Candida) e protozoários (Entamoeba). Ainda, inibidores de invasão de células tumorais interferem com a função de integrinas. Tomados em conjunto, esses dados abrem a possibilidade de se desenvolver a longo prazo uma estratégia de inibição da invasão celular pelo Trypanosoma cruzi, explorando proteínas dessa família possivelmente presentes no parasita Uma vez que a fibronectina, um ligante de integrina, se liga especificamente à superfície do T. cruzi é esperado que se encontem proteínas da família de integrinas no parasita. Assim, utilizaremos seqüências de integrinas de fungos e protozoários como "queries" para as buscas em bancos genômicos de T. cruzi. Ainda, além das buscas feitas por programas tipo Blast, utilizaremos outros, desenvolvidos por nosso grupo, que se utilizam de buscas por modelos de Markov (HMM) e Filogenômica. Os genes candidados identificados serão amplificados por PCR, clonados e utilizados para expressão heteróloga com o objetivo de se obter, à longo prazo, anticorpos específicos. Estes poderão ser utilizados em ensaios de inibição de invasão e purificação de isoformas nativas das proteínas. A obtenção de linhagens defectivas nas seqüências candidatas por "gene knock-out" será tentada, dependendo da estrutura e número de cópias no genoma do parasita. (AU)