Estudos da relação estrutura e função da proteína Nip7p e análise do seu papel no metabolismo de RNA em Saccharomyces cerevisiae e Homo sapiens

• Processo: 03/06299-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2003
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Nilson Ivo Tonin Zanchin
• Beneficiário: Patricia Pereira Coltri
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Saccharomyces cerevisiae Homo sapiens
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dominio Pua | Nip7P | Processamento De Rrna | Saccharomyces Cerevisiae | Sintese De Ribossomos

Resumo

A síntese de ribossomos em eucariotos é complexa tanto que células eucarióticas possuem uma organela, o nucléolo, devotada unicamente para esse fim. Os rRNAs são transcritos como precursores e passam por modificações covalentes além de extenso processamento endo- e exonucleolítico. O nucléolo é talvez a organela celular de atividade metabólica mais intensa onde atuam a maquinaria para transcrever os pré-rRNAs, os fatores envolvidos em processamento e maturação dos rRNAs (endo- e exonucleases, RNA helicases, pseudo-uridina sintetases, metilases e snoRNAs) até as proteínas ribossomais que se associam de forma coordenada aos rRNAs. A função específica da maioria dos fatores de processamento ainda é pouco conhecida. Nip7p é uma proteína nucleolarde 181 amino-ácidos, que possui um domínio encontrado em outras proteínas envolvidas no processamento de RNA, denominado PUA. A Nip7p é necessária para o processamento do pré-rRNA e sua deficiência afeta a formação da subunidades 60S em Saccharomyces cerevisiae. Homólogas da Nip7p são encontradas em todos os eucariotos e em Archaea, indicando que sua função é conservada. Neste projeto pretende-se prosseguir com a caracterização da Nip7p, visando determinar seu papel específico no processamento de rRNA. Os estudos estruturais serão conduzidos com a Nip7p além de suas homólogas de Homo sapiens e de Pyrococcus abyssii. Serão também desenvolvidos experimentos para caracterizar funcionalmente a HsNip7. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MORELLO, LUIS G.; COLTRI, PATRICIA P.; QUARESMA, ALEXANDRE J. C.; SIMABUCO, FERNANDO M.; SILVA, TEREZA C. L.; SINGH, GURAMRIT; NICKERSON, JEFFREY A.; OLIVEIRA, CARLA C.; MOORE, MELISSA J.; ZANCHIN, NILSON I. T.. The Human Nucleolar Protein FTSJ3 Associates with NIP7 and Functions in Pre-rRNA Processing. PLoS One, v. 6, n. 12, p. e29174, 2011. (08/57110-4, 07/58371-3, 03/06299-6, 06/02083-7)

SIMABUCO, FERNANDO M.; MORELLO, LUIS G.; BARBOSA ARAGAO, ANNELIZE ZAMBON; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; ZANCHIN, NILSON I. T.. Proteomic Characterization of the Human FTSJ3 Preribosomal Complexes. JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 11, n. 6, p. 3112-3126, JUN 2012. (08/57110-4, 07/58371-3, 03/06299-6, 06/02083-7)

MORELLO, LUIS G.; HESLING, CEDRIC; COLTRI, PATRICIA P.; CASTILHO, BEATRIZ A.; RIMOKH, RUTH; ZANCHIN, NILSON I. T.. The NIP7 protein is required for accurate pre-rRNA processing in human cells. Nucleic Acids Research, v. 39, n. 2, p. 648-665, JAN 2011. (06/02083-7, 06/57653-2, 07/58371-3, 98/14138-2, 03/06299-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

COLTRI, Patricia Pereira. Estudo funcional e estrutural de Nip7p, uma proteina conservada envolvida na sintese de ribossomos. 2007. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.