Proteinas envolvidas na etapa de brotamento do virus hiv-1: estudos por simulacao molecular.

• Processo: 03/07560-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2004
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2007
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Leo Degreve
• Beneficiário: Fernanda Marur Mazzé
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Mecânica estatística Elementos estruturais de proteínas Simulação de dinâmica molecular Interação proteína-proteína Biofísica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biofisica | Estrutura De Proteinas | Interacao Entre Proteinas | Mecanica Estatistica | Simulacao Molecular | Virus Hiv-1

Resumo

Há mais de duas décadas que as pesquisas sobre o vírus HIV-1, causador da AIDS, visam o completo conhecimento dos mecanismos que o vírus utiliza durante o seu ciclo de vida. Um passo essencial na replicação deste vírus é a etapa de brotamento que promove a saída das novas partículas virais da célula hospedeira. A proteína viral, envolvida neste processo é a proteína p6gag e nela, especificamente, uma região denominada L-domínio. Estudos recentes indicam que uma proteína celular, TSG101, interage com o L-domínio para promover a saída completa do vírus HIV-1 da célula. A região N-terminal de TSG101 (domínio UEV) é homóloga às proteínas E2 ligases que, ao interagirem com a proteína ubiquitina, fazem parte da maquinaria celular de degradação protéica. A interação TSG101/L-domínio torna-se ainda mais evidente quando observa-se que a ubiquitina também é necessária na etapa de brotamento do vírus HIV-1, ou seja, o domínio UEV de TSG101 é um sítio de ação catalítica para a ubiquitina e o L-domínio da proteína p6gag na etapa final do ciclo de vida do viris HIV-1. O objetivo deste trabalho é estudar o mecanismo da etapa de brotamento do ciclo de vida do vírus HIV-1. Por simulação molecular, serão estudadas as proteínas TSG101, ubiquitina, p6gag e E2 ligase em solução aquosa, bem como os mecanismos de interação entre essas proteínas. Os resultados desses estudos poderão contribuir para o desenvolvimento de novos inibidores do ciclo de vida do vírus HIV-1. (AU)