Análise genômica e transcriptoma em câncer de colo uterino

• Processo: 05/51329-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2005
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunogenética
• Pesquisador responsável: Maria Gerbase de Lima
• Beneficiário: Karina Lumi Mine
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Neoplasias do colo uterino Transcriptômica Polimorfismo genético Expressão gênica Reação em cadeia da polimerase em tempo real
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cancer Colo Uterino | Expressao Genica | Genomica | Microarray | Polimorfismo | Transcriptomica

Resumo

Este projeto insere-se em uma linha de pesquisa de nosso laboratório sobre o estudo de fatores genéticos envolvidos na susceptibilidade ao carcinoma de colo uterino e na persistência do tumor após o tratamento. No presente projeto, os genes a serem investigados serão inicialmente selecionados através da análise de expressão gerada pela metodologia de microarray. Esta seleção consiste em identificar os genes que apresentam as maiores diferenças de expressão entre tecido tumoral e normal e entre amostras em que o tumor persistiu e não persistiu após o tratamento. Em seguida, dentre estes genes, selecionaremos os que apresentam polimorfismos em regiões regulatórias, para estudo tipo caso-controle. Pretendemos também com as análises dos microarrays, verificar se existe um padrão de expressão gênica entre amostras de tumores que apresentam ou não persistência do tumor após o tratamento. Buscamos, assim, definir um perfil de expressão que seja capaz de predizer a persistência do tumor, condição esta que ocorre em 30% das pacientes. A partir dos perfis gênicos escolhidos, o número mínimo de genes necessário para caracterizar as amostras será determinado e estes genes serão validados por Real Time RT-PCR. Além de estudar a expressão de transcritos codantes, estudaremos também a de transcritos não codantes e anti-sense, visto que estes podem ter papéis regulatórios importantes no mecanismo de expressão gênica. (AU)