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Construção e caracterização de mini-bibliotecas de EST geradas com RT-PCR de baixa estringencia e clonagem de uma apirase de Schistosoma mansoni

Texto completo
Autor(es):
Ricardo de Marco
Número total de Autores: 1
Tipo de documento: Tese de Doutorado
Imprenta: São Paulo.
Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ)
Data de defesa:
Membros da banca:
Sergio Verjovski Almeida; Wim Maurits Sylvain Degrave; Emmanuel Dias Neto; Hamza Fahmi Ali El Dorry; Hernando Antonio Del Portillo Obando
Orientador: Sergio Verjovski Almeida
Resumo

Este trabalho demonstrou a construção de minibibliotecas de \"Expressed Sequence Tags\" (EST) com o uso de RT-PCR de baixa estringencia e \"primer\" consenso-degenerado. Através do estudo de parâmetros críticos como concentração de sais, temperatura e velocidade de ciclagem, composição dos \"primers\" e qualidade do RNA mensageiro, foi possível padronizar um protocolo. Tal protocolo permitiu um aumento do numero de seqüências por minibiblioteca em relação a protocolos similares existentes na literatura (Dias neto et al., 1997 e 2000) sem perda de características desejáveis como amplificação preferencial do centro dos genes e nomalização das mensagens. As seqüências produzidas levaram a um significativo aumento das seqüências de EST de S. mansoni disponíveis publicamente e permitiu a detecção da existência de novos fragmentos de genes expressos na fase adulta do parasita. Neste trabalho também clonamos uma apirase de S. mansoni cuja a seqüência não havia sido descrita anteriormente. O gene possui cerca de 2,7 mil pares de bases e codifica para uma proteína de 544 aminoácidos. Esta foi expressa em sistema heterologo e utilizada para obtenção de anticorpos policlonais contra esta proteína. Utilizando estes anticorpos foi possível detectar a proteína no tegumento do parasita. (AU)

Processo FAPESP: 98/15660-4 - Construção e caracterização de minibibliotecas de EST de Schistossoma mansoni geradas com primers híbridos consenso-degenerado
Beneficiário:Ricardo de Marco
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado