Identificação e caracterização de novos efetores secretados pelo sistema de secreção do tipo VI em Salmonella spp

Autor(es)

Stephanie Sibinelli de Sousa

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI)
• Data de defesa: 2023-12-04

Membros da banca

Ethel Bayer Santos; Rodrigo da Silva Galhardo; Cristiano Gallina Moreira; Uelinton Manoel Pinto

• Orientador: Ethel Bayer Santos; Robson Francisco de Souza

Resumo

Bactérias vivem em comunidades polimicrobianas complexas, e utilizam diversas estratégias para competir por recursos. Bactérias Gram-negativas codificam um sistema de secreção de proteínas do tipo VI (T6SS) capaz de secretar efetores dentro de células-alvo, tanto eucarióticas como procarióticas. Salmonella spp. codificam cinco T6SSs filogeneticamente distintos em diferentes ilhas de patogenicidade (Salmonella Pathogenicity Island): SPI-6, SPI-19, SPI-20, SPI-21 e SPI-22. Trabalhos anteriores demonstraram a importância do SPI-6 T6SS de S. Typhimurium e do SPI-19 T6SS de S. Gallinarum para a competição bacteriana e infecção de macrófagos, respectivamente. No entanto, poucos efetores secretados pelos T6SSs de Salmonella foram descritos. Neste contexto, o projeto teve como objetivo identificar e caracterizar novos efetores do T6SS de Salmonella utilizando abordagens computacionais e experimentais. Primeiramente, foi identificada e caracterizada uma nova família de efetores antibacterianos que atuam sobre a parede celular de bactérias competidoras via um novo mecanismo de ação: L,D-carboxipeptidase e L,D-transpeptidase de troca de D aminoácidos. Em seguida, utilizando uma abordagem mais abrangente, foram realizados ensaios de co-imunoprecipitação com componentes estruturais do T6SS (hemolysin-coregulated proteins, Hcps) e seus parceiros de interação foram identificados por espectrometria de massas. Além disso, foram examinados 10 mil genomas de Salmonella em busca de novos efetores do T6SS empregando estratégias in silico. Como resultado, uma grande variedade de possíveis efetores foram identificados, revelando uma ampla diversidade de efetores do T6SS presentes em Salmonella, alguns deles contendo domínios proteicos com função desconhecida. Como forma de validar nossas análises, foi escolhido um possível efetor (STox15) para a caracterização bioquímica e funcional. Resultados mostraram que STox15 e SImm15 constituem um novo par efetor antibacteriano e proteína de imunidade do T6SS. De maneira geral, este projeto contribuiu para ampliar o conhecimento sobre os efetores do T6SS de Salmonella e sua importância em competições bacterianas e infecções de hospedeiros vertebrados. (AU)

• Processo FAPESP: 21/09162-0 - Estudo da função de diferentes proteínas Hcp codificadas por Salmonella spp
• Beneficiário: Stephanie Sibinelli de Sousa
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto