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Shaker Chuck Farah

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Israel

Possui graduação em Bioquímica e Química pela University of Toronto (1985), mestrado em Bioquímica também pela University of Toronto (1988) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1994). Atualmente é professor Titular no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. O foco principal da sua pesquisa é entender a base estrutural de processos importantes para a comportamentos bacterianos complexos, utilizando como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico. Os sistemas sob estudo incluem: i) Vias de sinalização que envolvem o importante segundo mensageiro bis(3´-5´)diGMP cíclico (c-diGMP) que controla comportamentos complexos em bactéria como produção de fatores patogênicos, pili de tipo IV, motilidade e formação de biofilmes, ii) O funcionamento e regulação do pilus do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para se translocar sobre superfícies sólidas (motilidade "twitching") e para se organizar em biofilmes, iii) O funcionamento do sistema de secreção do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para transferir toxinas para outras bactérias, iv) O fenômeno de 'quorum sensing' pelo qual bactérias dentro de uma população coordenam suas atividades em uma maneira dependente de densidade celular. Suas pesquisas técnicas de biologia estrutural (cristalografia, microscopia eletrônica e RMN de proteínas), espectroscopia, microscopia de fluorescência, produção de nocautes gênicos e a análise de redes de interação proteína-proteína. (Fonte: Currículo Lattes)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o(a) pesquisador(a)
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
5-Hidroxitriptofano Actinas Análise de sequência de DNA Aquisição de equipamentos Biblioteca gênica Biofilmes Biofísica Celular Biofísica Molecular Biofísica Biologia Molecular Biologia e Fisiologia dos Microorganismos Biologia estrutural Biologia molecular Bioquímica de Microorganismos Bioquímica Cancro (doença de planta) Caulobacter crescentus Ciências Biológicas Ciências Exatas e da Terra Clonagem Clorose variegada dos citros Coccidiose Contração muscular Cristalografia de proteínas Cristalografia Cromatografia líquida Difração por raios X Eimeria Elementos estruturais de proteínas Enzimas Enzimologia Equipamentos multiusuários Expressão de proteínas Fator sigma Fenótipo Fitopatologia Fluorescência Genes Genomas Genômica Guanilato ciclase Interação proteína-proteína Intercâmbio de pesquisadores Leptospira interrogans Leptospirose Macromolécula Metaboloma Microbiologia Microscopia eletrônica Miosinas Músculos Mutação puntual Mutação Mutagênese Paramecium caudatum Percepção de Quorum Produtos naturais Proteínas recombinantes Proteínas Purificação de proteínas Química de Macromoléculas Química RNA polimerases Recursos para a pesquisa Ressonância magnética nuclear Sistema musculoesquelético Sistemas de secreção bacterianos Stenotrophomonas maltophilia Técnicas de genotipagem Termodinâmica Toxinas Triptofano Tropomiosina Virulência Vírus de RNA Vitrificação Xanthomonas axonopodis Xanthomonas citri Xanthomonas Xylella fastidiosa
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (23)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações22
Citações194
Cit./Artigo8,8
Dados do Web of Science

GUZZO, CRISTIANE R.; NAGEM, RONALDO A. P.; GALVÃO-BOTTON, LEONOR M. P.; GUIMARÃES, BEATRIZ G.; MEDRANO, FRANCISCO J.; BARBOSA, JOÃO A. R. G.; FARAH, SHAKER CHUCK. Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of YaeQ (XAC2396) from Xanthomonas axonopodis pv. citri. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 61, n. 5, p. 493-495, . (01/07534-3)

CORREA, FERNANDO; SALINAS, ROBERTO KOPKE; BONVIN, ALEXANDRE M. J. J.; FARAH, CHUCK S.. Deciphering the role of the electrostatic interactions in the alpha-tropomyosin head-to-tail complex. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 73, n. 4, p. 902-917, . Citações Web of Science: 5. (05/59243-3)

GUZZO, CRISTIANE R.; DUNGER, GERMAN; SALINAS, ROBERTO KOPKE; FARAH, CHUCK S.. Structure of the PilZ-FimX(EAL)-c-di-GMP Complex Responsible for the Regulation of Bacterial Type IV Pilus Biogenesis. Journal of Molecular Biology, v. 425, n. 12, p. 2174-2197, . Citações Web of Science: 24. (09/14477-8, 11/22571-4, 11/07777-5)

BAYER-SANTOS, ETHEL; CESETI, LUCAS DE MORAES; FARAH, CHUCK SHAKER; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA ELISA. Distribution, Function and Regulation of Type 6 Secretion Systems of Xanthomonadales. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 0. (18/04553-8, 17/17303-7, 17/02178-2, 18/01852-4, 17/02318-9)

OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SOUZA, DIORGE PAULO; OKA, GABRIEL UMAJI; LIMA, FILIPE DA SILVA; OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; FAVARO, DENIZE CRISTINA; WIENK, HANS; BOELENS, ROLF; FARAH, CHUCK SHAKER; SALINAS, ROBERTO KOPKE. VirB7 and VirB9 Interactions Are Required for the Assembly and Antibacterial Activity of a Type IV Secretion System. Structure, v. 24, n. 10, p. 1707-1718, . Citações Web of Science: 3. (13/17883-2, 11/07777-5)

BAYER-SANTOS, ETHEL; MARINI, MARJORIE M.; DA SILVEIRA, JOSE F.. Non-coding RNAs in Host-Pathogen Interactions: Subversion of Mammalian Cell Functions by Protozoan Parasites. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 8, . Citações Web of Science: 9. (15/25381-2, 11/51475-3)

CENENS, WILLIAM; ANDRADE, MAXUEL O.; LLONTOP, EDGAR; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; SGRO, GERMAN G.; FARAH, CHUCK S.. Bactericidal type IV secretion system homeostasis in Xanthomonas citri. PLOS PATHOGENS, v. 16, n. 5, . Citações Web of Science: 0. (19/12234-2, 15/18237-2, 14/04294-1, 17/17303-7, 11/07777-5)

SGRO, GERMAN G.; OKA, GABRIEL U.; SOUZA, DIORGE P.; CENENS, WILLIAM; BAYER-SANTOS, ETHEL; MATSUYAMA, BRUNO Y.; BUENO, NATALIA F.; DOS SANTOS, THIAGO RODRIGO; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; SALINAS, ROBERTO K.; et al. Bacteria-Killing Type IV Secretion Systems. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . Citações Web of Science: 2. (17/17303-7, 17/02178-2, 18/01852-4)

ANTUNES, VICTOR U.; LLONTOP, EDGAR E.; VASCONCELOS, FERNANDA N. DA COSTA; DE LOS SANTOS, YOSSEF LOPEZ; OLIVEIRA, RONALDO J.; LINCOPAN, NILTON; FARAH, CHUCK S.; DOUCET, NICOLAS; MITTERMAIER, ANTHONY; FAVARO, DENIZE C.. Importance of the beta 5-beta 6 Loop for the Structure, Catalytic Efficiency, and Stability of Carbapenem-Hydrolyzing Class D beta-Lactamase Subfamily OXA-143. BIOCHEMISTRY, v. 58, n. 34, p. 3604-3616, . Citações Web of Science: 0. (17/17303-7, 17/22822-3)

BAYER-SANTOS, ETHEL; CENENS, WILLIAM; MATSUYAMA, BRUNO YASUI; OKA, GABRIEL UMAJI; DI SESSA, GIANCARLO; MININEL, IZABEL DEL VALLE; ALVES, TIAGO LUBIANA; FARAH, CHUCK SHAKER. The opportunistic pathogen Stenotrophomonas maltophilia utilizes a type IV secretion system for interbacterial killing. PLOS PATHOGENS, v. 15, n. 9, . Citações Web of Science: 1. (18/04553-8, 17/02178-2, 15/18237-2, 17/17303-7, 15/25381-2, 16/00458-5, 11/07777-5)

SOUZA, DIORGE P.; ANDRADE, MAXUEL O.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; ARANTES, GUILHERME M.; FARAH, CHUCK S.; SALINAS, ROBERTO K.. A Component of the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System Combines a VirB7 Motif with a N0 Domain Found in Outer Membrane Transport Proteins. PLOS PATHOGENS, v. 7, n. 5, p. e1002031, . Citações Web of Science: 29. (05/59243-3, 07/52735-3, 06/61091-0)

SOUZA, DIORGE P.; OKA, GABRIEL U.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; BISSON-FILHO, ALEXANDRE W.; DUNGER, GERMAN; HOBEIKA, LISE; CAVALCANTE, NAYARA S.; ALEGRIA, MARCOS C.; BARBOSA, LEANDRO R. S.; SALINAS, ROBERTO K.; et al. Bacterial killing via a type IV secretion system. NATURE COMMUNICATIONS, v. 6, . Citações Web of Science: 40. (05/59243-3, 07/59425-0, 09/54009-3, 11/07777-5)

BAYER-SANTOS, ETHEL; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; CESETI, LUCAS DE MORAES; RATAGAMI, CAMILA YURI; DE SANTANA, ELIANE SILVA; DA SILVA, ALINE MARIA; FARAH, CHUCK SHAKER; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA ELISA. Xanthomonas citri T6SS mediates resistance to Dictyostelium predation and is regulated by an ECF sigma factor and cognate Ser/Thr kinase. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 4, SI, p. 1562-1575, . Citações Web of Science: 6. (11/07777-5, 14/25261-4, 14/19720-6, 15/25381-2, 16/08400-6)

TEIXEIRA, RAPHAEL D.; GUZZO, CRISTIANE R.; AREVALO, SANTIAGO JUSTO; ANDRADE, MAXUEL O.; ABRAHAO, JOSIELLE; DE SOUZA, ROBSON F.; FARAH, CHUCK S.. A bipartite periplasmic receptor-diguanylate cyclase pair (XAC2383-XAC2382) in the bacterium Xanthomonas citri. Journal of Biological Chemistry, v. 293, n. 27, p. 10767-10781, . Citações Web of Science: 0. (11/07777-5)

CESETI, LUCAS M.; DE SANTANA, ELIANE S.; RATAGAMI, CAMILA Y.; BARREIROS, YASMIN; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; DUNGER, GERMAN; FARAH, CHUCK S.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.. The Xanthomonas citri pv. citri Type VI Secretion System is Induced During Epiphytic Colonization of Citrus. Current Microbiology, v. 76, n. 10, p. 1105-1111, . Citações Web of Science: 0. (11/22571-4, 16/08400-6, 14/19720-6, 17/02318-9, 18/01852-4, 14/25261-4, 11/07777-5)

SIBINELLI-SOUSA, STEPHANIE; HESPANHOL, JULIA T.; NICASTRO, GIANLUCCA G.; MATSUYAMA, BRUNO Y.; MESNAGE, STEPHANE; PATEL, ANKUR; DE SOUZA, ROBSON F.; GUZZO, CRISTIANE R.; BAYER-SANTOS, ETHEL. A Family of T6SS Antibacterial Effectors Related to L,D-Transpeptidases Targets the Peptidoglycan. CELL REPORTS, v. 31, n. 12, . Citações Web of Science: 0. (18/04553-8, 17/02178-2, 16/09047-8, 19/00195-2, 17/17303-7, 18/25316-4, 16/00458-5, 18/13819-1)

DUNGER, GERMAN; GAROFALO, CECILIA G.; GOTTIG, NATALIA; GARAVAGLIA, BETIANA S.; PEREDA ROSA, MARIA C.; FARAH, CHUCK S.; ORELLANO, ELENA G.; OTTADO, JORGELINA. Analysis of three Xanthomonas axonopodis pv. citri effector proteins in pathogenicity and their interactions with host plant proteins. MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, v. 13, n. 8, p. 865-876, . Citações Web of Science: 13. (05/59243-3)

CAPPELLETTI, PAOLA A.; DOS SANTOS, RAFAEL FREITAS; DO AMARAL, ALEXANDRE M.; HOMEM, RAFAEL AUGUSTO; SOUZA, THAIS DOS SANTOS; MACHADO, MARCOS A.; FARAH, CHUCK S.. Structure-Function Analysis of the HrpB2-HrcU Interaction in the Xanthomonas citri Type III Secretion System. PLoS One, v. 6, n. 3, p. e17614, . Citações Web of Science: 6. (05/59243-3)

OLIVEIRA, MAYCON C.; TEIXEIRA, RAPHAEL D.; ANDRADE, MAXUEL O.; PINHEIRO, GLAUCIA M. S.; RAMOS, CARLOS H. I.; FARAH, CHUCK S.. Cooperative Substrate Binding by a Diguanylate Cyclase. Journal of Molecular Biology, v. 427, n. 2, p. 415-432, . Citações Web of Science: 10. (11/07777-5)

ABIKO, LAYARA AKEMI; VITALE, PHELIPE M.; FAVARO, DENIZE C.; HAUK, PRICILA; LI, DA-WEI; YUAN, JIAQI; BRUSCHWEILER-LI, LEI; SALINAS, ROBERTO K.; BRUSCHWEILER, RAFAEL. Model for the allosteric regulation of the Na+/Ca2+ exchanger NCX. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 84, n. 5, p. 580-590, . Citações Web of Science: 3. (13/50355-0, 13/17883-2, 11/07777-5)

DUNGER, GERMAN; LLONTOP, EDGAR; GUZZO, CRISTIANE R.; FARAH, CHUCK S.. The Xanthomonas type IV pilus. Current Opinion in Microbiology, v. 30, p. 88-97, . Citações Web of Science: 10. (11/07777-5)

DUNGER, GERMAN; GUZZO, CRISTIANE R.; ANDRADE, MAXUEL O.; JONES, JEFFREY B.; FARAH, CHUCK S.. Xanthomonas citri subsp citri Type IV Pilus Is Required for Twitching Motility, Biofilm Development, and Adherence. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 27, n. 10, p. 1132-1147, . Citações Web of Science: 22. (11/22571-4, 11/07777-5)

SGRO, GERMAN G.; COSTA, TIAGO R. D.; CENENS, WILLIAM; SOUZA, DIORGE P.; CASSAGO, ALEXANDRE; DE OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SALINAS, ROBERTO K.; PORTUGAL, V, RODRIGO; FARAH, CHUCK S.; WAKSMAN, GABRIEL. Cryo-EM structure of the bacteria-killing type IV secretion system core complex from Xanthomonas citri. NATURE MICROBIOLOGY, v. 3, n. 12, p. 1429-1440, . Citações Web of Science: 11. (17/17303-7, 11/07777-5)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ALEGRIA, Marcos Castanheira. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos Loci hrp, vir e rpf de Xanthomonas axonopodis pv. citri.  215 f. Tese (Doutorado) -  Instituto de Química.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (98/15371-2

FERREIRA, Aurea Denise de Sousa Soller. Tropomiosinas contendo 5-hidroxitriptofano: sondas específicas para interações no filamento fino.  131 f. Tese (Doutorado) -  Instituto de Química.  Universidade de São Paulo (USP).  São Paulo.  (00/00686-0

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