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Uma análise quantitativa do papel de éxon shuffling durante a evolução: uma abordagem genômica

Processo: 00/02228-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2000
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2002
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Sandro José de Souza
Beneficiário:Fabio Passetti
Instituição Sede: Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer (ILPC). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Evolução biológica   Genomas   Análise de sequência de DNA   Éxons   Íntrons
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Evolucao | Exon Shuffling | Genoma | Intron

Resumo

Os bancos públicos de seqüência têm crescido nos últimos anos em função principalmente da contínua adição de novas informações por meio dos projetos genoma. Este acréscimo exponencial tem sido possível graças também às "Expressed Sequence Tags" (ESTs). A função e a arquitetura dos genes está começando a ser elucidada a partir do estudo do genoma completo tanto de procariotos como de eucariotos. Do ponto de vista evolutivo, muitos estudos tem sido feitos a respeito de "exon shuffling", eventos responsáveis pelo surgimento de verdadeiros mosaicos gênicos que podem ser resumidamente explicadas como sendo recombinações de DNA mediadas por íntrons. O presente projeto tem como objetivos: 1) a construção de um banco de dados contendo informações a respeito de eventos de "exon shuffling" identificados a partir de análise computacional de todas as seqüências genômicas presentes nos bancos públicos; 2) análise filogenética dos respectivos eventos identificados dando especial atenção a: C. elegans, S. cerevisiae, D. melanogaster e H. sapiens; e 3) proposta de uma caracterização funcional das proteínas envolvidas nos eventos de exon shuffling caracterizados pelo processo acima. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SAKHARKAR‚ M.; PASSETTI‚ F.; DE SOUZA‚ JE; LONG‚ M.; DE SOUZA‚ SJ. ExInt: An exon intron database. Nucleic Acids Research, v. 30, n. 1, p. 191-194, . (00/02228-9)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
PASSETTI, Fabio. Diversidade na arquitetura e expressão gênica: uma análise quantitativa de Exon shuffling e splicing alternativo. 2002. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.