Determinação do tropismo do HIV-1 pelos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelo uso de ferramentas de bioinformática

Resumo

Durante a história natural da infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) ocorre a mudança do tropismo das cepas R5 para X4 ou R5X4, ocasionando na depleção das células T e aceleração da progressão da infecção. A ocorrência de mutações nos aminoácidos da região V3 da gp120 do gene env leva a alteração da carga elétrica global desta região e, conseqüentemente, mudança de tropismo pelo co-receptor. A determinação do tropismo é essencial para utilização dos antagonistas de co-receptor como estratégia terapêutica. O tropismo pode ser determinado através de programas preditores da bioínformática que predizem o uso do co-receptor a partir de seqüências de aminoácidos ou nucleotídeos da região V3, os quais também podem avaliar alterações genotípicas características do tropismo viral. Desta forma, é possível determinar precocemente a mudança do tropismo, contribuindo com a adoção de estratégias terapêuticas para impedir o surgimento de cepas X4. Por estas razões, nosso estudo se propõe identificar o padrão de uso dos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelas cepas do HIV-1, as características genotípicas envolvidas no tropismo viral e estratégias de predição do tropismo viral através da análise do seqüenciamento da região V3 da gp120 do envelope do HIV-1 pelo uso de ferramentas de bioinformática. (AU)