Avaliação da expressão alélica em genes associados à maciez de carne em animais Nelore por meio de análise transcriptômica.

Resumo

A maciez da carne bovina é a característica mais apreciada pelo consumidor mundial, no entanto, teve pouco destaque nos programas de melhoramento de gado de corte no Brasil até o presente momento, devido ao fato da maciez ser mensurada tardiamente, após o abate do animal. Assim, como alternativa para aumentar a competitividade do país no comércio internacional de carne, estudos de genética molecular têm focado características de qualidade como a maciez da carne. Identificar polimorfismos em genes que ajudam a explicar a variância fenotípica dessa característica pode auxiliar na predição precoce do potencial genético do animal que, somadas às ferramentas clássicas de melhoramento genético resultariam na maximização da resposta à seleção. Contudo, para definir a real contribuição das diferenças de sequência de DNA na diversidade fenotípica é preciso compreender os mecanismos que regulam a expressão gênica, já que variações na expressão dos genes também podem resultar em variação fenotípica entre indivíduos. Diferenças de expressão alélica (EAD; expressão alélica diferencial) também podem contribuir para diversidade fenotípica, e esse campo tem sido pouco estudado em bovinos. A EAD dependente da origem parental do alelo, como ocorre no caso de genes imprinted, pode influenciar na precisão da seleção e afetar os modelos estatísticos do melhoramento animal por causarem diferenças entre valores genéticos preditos e observados. Assim, o presente trabalho tem por objetivo analisar a distribuição da EAD ao longo do genoma bovino em tecido muscular a fim de identificar genes associados com maciez que apresentam padrão de expressão imprint ou EAD, além de elucidar as possíveis causas do desequilíbrio alélico. Para isso será realizado o sequenciamento do genoma de 17 animais de cada extremo para a característica maciez da carne por meio de tecnologias de nova geração, equipamento HiScanSQ da Illumina e a validação do desequilíbrio da expressão alélica será feito por sistema TaqMan®. Assim este estudo irá ampliar o conhecimento científico e identificar genes associados à maciez que apresentem variações na expressão alélica, podendo ser incluídos posteriormente nos modelos estatísticos visando maior precisão no melhoramento genético de bovinos.