Decifrando a resistência do feijoeiro contra a doença antracnose: Transcritoma e identificação de genes responsivos a interação compatível e incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum

Resumo

Os estudos transcritômicos e de expressão gênica do sistema-fitopatogênico Phaseolus vulgaris vs Colletotrichum lindemuthianum desenvolvidos no Laboratório de Biologia Celular e Molecular do CENA (USP) têm revelado grupos gênicos tecido-específicos que atuam no mecanismo de defesa do feijoeiro em relação ao patógeno da antracnose. No entanto, o perfil de transcritos decisivos para as respostas biológicas localizadas (célula-específicos) ainda não foram descritos para este sistema, podendo ser alcançado com o uso da combinação dos métodos de microdissecção a laser e sequenciamento de RNA. Como hipóteses deste trabalho estão: 1) existem diferenças de expressão gênica entre células de tecidos foliares durante a interação compatível (Diamante Negro vs. raça 81) e incompatível (IAC-UNA vs. raça 81) de feijoeiro vs. patógeno da antracnose (contato hospedeiro-patógeno); 2) existem diferenças de expressão gênica nas células adjacentes à região de contato hospedeiro-patógeno, considerando tempo de interação; 3) existe reprodutibilidade do modelo definido de genes relacionados à defesa em outros genótipos de feijoeiro resistentes à doença. Dessa forma, células-alvo de tecidos foliares infectados com C. lindemuthianum raça 81 serão excisadas por meio de microscopia de microdissecção a laser (Leica), de onde o RNA total será isolado e processado para sequenciamento no equipamento MiSeq Personal Sequencer (Illumina). As análises e comparações entre os dados transcritômicos obtidos serão realizadas com o uso de programas de bioinformática como o Galaxy, Blast2GO e MapMan. Os resultados obtidos serão validados através do método reverse trancriptase-PCR quantitativo (RT-qPCR). A validação destes como relacionados à defesa da planta será determinada testando-os em outros genótipos de feijoeiro resistentes a antracnose.