Modelagem molecular das interações do complexo antígeno-anticorpo na investigação de doenças desmielinizantes autoimunes

Resumo

A esclerose múltipla (EM) é uma doença inflamatória desmielinizante autoimune que pode levar ao dano axonal. Os mecanismos moleculares envolvidos na manifestação da doença ainda continuam obscuros para a comunidade científica, apesar dos esforços com as pesquisas envolvendo a Encefalomielite Experimental Autoimune (EAE), que é modelo experimental da EM. O sistema imunológico é considerado fundamental no desenvolvimento da EM, tendo em vista as evidências na literatura da participação dos anticorpos autorreativos contra a glicoproteína de oligodendrócito da mielina e a proteína básica da mielina. Assim, com os avanços recentes da Modelagem Molecular Computacional (MMC), o presente projeto tem como objetivo central a aplicação dessa abordagem na descrição dos mecanismos moleculares de interações específicas do complexo antígeno-anticorpo relacionadas à EM e ao modelo experimental, a EAE. A metodologia envolve: (I) levantamento na literatura das informações relevantes sobre a doença e as proteínas de trabalho; (II) análise das estruturas tridimensionais disponíveis e otimização de modelos estruturais por Modelagem por Homologia; (III) aplicação do docking molecular para prever as orientações favoráveis das moléculas envolvidas; (IV) realização de simulações computacionais de dinâmica molecular do comportamento do sistema através de trajetórias de simulação; (V) aplicação de Mecânica Quântica (MQ) nas posições moleculares relevantes das trajetórias obtidas. A correlação entre os resultados teóricos e experimentais de microscopia de força atômica será realizada com simulações de dinâmica molecular direcionada, SMD, do inglês Steered Molecular Dynamics, e interpretada através da termodinâmica estatística. (AU)