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A meta-omics approach to examine disturbances in soils of the Brazilian Amazonia

Processo: 16/02219-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2016
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2018
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
Pesquisador responsável:Fernando Dini Andreote
Beneficiário:Victor Satler Pylro
Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50320-4 - Dimensões US-BIOTA - São Paulo: pesquisa colaborativa: integrando as dimensões da biodiversidade microbiana ao longo de áreas de alteração do uso da terra em florestas tropicais, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Ecologia microbiana
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análises independentes de cultivo | Ecologia Microbiana

Resumo

Esta proposta busca a utilização conjunta dos métodos de sequenciamento de alto rendimento de DNA e RNA a partir de amostras ambientais, juntamente com dados de metodologias baseadas em cultivo - genômica e fisiologia, para obter informações sobre o funcionamento de comunidades microbianas em solos da Amazônia brasileira. Esta combinação constituirá um esforço para correlacionar alterações no uso do solo, com a ocorrência de grupos e processos microbianos, com foco na geração e consumo de metano. (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PYLRO, VICTOR SATLER; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO; FASANELLA ANDREOTE, CRISTIANE CIPOLLA; DE ALMEIDA BERNARDO, EDUARDO ROBERTO; ZUCCHI, TIAGO. Closed Genome Sequence of Phytopathogen Biocontrol Agent Bacillus velezensis Strain AGVL-005, Isolated from Soybean. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 7, . (14/50320-4, 16/02219-8)
LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO; DE SOUZA, ROSINEIDE CARDOSO; CANNAVAN, FABIANA DE SOUZA; PATRICIO, ANDRE; PYLRO, VICTOR SATLER; HANADA, ROGERIO EIJI; MUI, TSAI SIU. Metagenome sequencing of the microbial community of two Brazilian anthropogenic Amazon dark earth sites, Brazil. GENOMICS DATA, v. 10, p. 167-168, . (13/02760-2, 14/50320-4, 16/18215-1, 11/50914-3, 16/02219-8)
RODRIGUES, EDMO MONTES; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; PYLRO, VICTOR SATLER; REDMILE-GORDON, MARC; DE OLIVEIRA, JURACI ALVES; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO; CESAR, DIONEIA EVANGELISTA; TOTOLA, MARCOS ROGERIO. Aliphatic Hydrocarbon Enhances Phenanthrene Degradation by Autochthonous Prokaryotic Communities from a Pristine Seawater. MICROBIAL ECOLOGY, v. 75, n. 3, p. 688-700, . (16/02219-8)
MORAIS, DANIEL K.; ROESCH, LUIZ F. W.; REDMILE-GORDON, MARC; SANTOS, FAUSTO G.; BALDRIAN, PETR; ANDREOTE, FERNANDO D.; PYLRO, VICTOR S.. BTW-Bioinformatics Through Windows: an easy-to-install package to analyze marker gene data. PeerJ, v. 6, . (14/50320-4, 16/02219-8)
MULLER BARBOZA, ANTHONY DIEGO; PYLRO, VICTOR SATLER; SEMINOT JACQUES, RODRIGO JOSEMAR; GUBIANI, PAULO IVONIR; FERREIRA DE QUADROS, FERNANDO LUIZ; DA TRINDADE, JULIO KUHN; TRIPLETT, ERIC W.; ROESCH, LUIZ. Seasonal dynamics alter taxonomical and functional microbial profiles in Pampa biome soils under natural grasslands. PeerJ, v. 6, . (16/02219-8)
PYLRO, VICTOR SATLER; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO; FASANELLA ANDREOTE, CRISTIANE CIPOLLA; DE ALMEIDA BERNARDO, EDUARDO ROBERTO; ZUCCHI, TIAGO. Closed Genome Sequence of Phytopathogen Biocontrol Agent Bacillus velezensis Strain AGVL-005, Isolated from Soybean. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 7, p. 2-pg., . (14/50320-4, 16/02219-8)
ALVES, KELLY JAQUELINE; PYLRO, VICTOR SATLER; NAKAYAMA, CRISTINA ROSSI; VITAL, VITOR GONCALVES; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; SANTOS, DANIELLE GONCALVES; RODRIGUES, JORGE L. MAZZA; TSAI, SIU MUI; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Methanogenic communities and methane emissions from enrichments of Brazilian Amazonia soils under land-use change. MICROBIOLOGICAL RESEARCH, v. 265, p. 9-pg., . (14/50320-4, 16/18745-0, 16/02219-8)