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Filogeografia de duas espécies simpátricas de ratos-de-espinho da Amazônia Ocidental

Processo: 16/24464-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 29 de julho de 2017
Data de Término da vigência: 28 de julho de 2018
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
Pesquisador responsável:Alexandre Reis Percequillo
Beneficiário:Jeronymo Dalapicolla
Supervisor: Laura Lacey Knowles
Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Michigan, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:15/02853-6 - Taxonomia integrativa do gênero Proechimys (Rodentia: Echimydae) da Amazônia Ocidental, BP.DR
Assunto(s):Echimyidae   Genômica   Proechimys   Biogeografia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biogeography | ddRAD-Seq | echimyidae | Genomics | Proechimys | species distribution modelling | Biogeografia

Resumo

Proechimys é um gênero da família Echimyidae amplamente distribuído na Amazônia. Embora seja abundante e amplamente distribuído este gênero é raramente estudado, e há poucos dados publicados sobre sua evolução e história natural. Assim, o objetivo desta proposta é investigar o padrão filogeográfico de duas espécies simpátricas de Proechimys da Amazônia Ocidental. Para isso vou gerar três bibliotecas genômicas com 180 amostras usando a técnica ddRAD-Seq. Os SNPs serão alinhados e processados para análises filogeográficas e populacionais. Além disso, serão criados modelos de distribuição de espécies para as duas espécies-alvo, para o Último Máximo Glacial, Holoceno Médio e para o presente, a fim de analisar se as mudanças ambientais ao longo do tempo poderiam explicar a variabilidade genética. Os índices de diversidade genética serão calculados para as populações e as relações dessa diversidade com a geografia serão analisadas através de uma análise de Procrustes. Além disso, uma hipótese de filogenia para o gênero Proechimys será criada para verificar a relação filogenética entre espécies-alvo. Assim, a expectativa é aumentar o conhecimento sobre a dinâmica populacional dessas espécies, bem como aumentar a informação sobre sua história natural e evolutiva do gênero. Esses dados servirão de subsídios para estudos sobre ecologia, taxonomia, evolução e conservação de espécies de Proechimys.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DALAPICOLLA, JERONYMO; DO PRADO, JOYCE RODRIGUES; PERCEQUILLO, ALEXANDRE REIS; KNOWLES, L. LACEY. unctional connectivity in sympatric spiny rats reflects different dimensions of Amazonian forest-associatio. Journal of Biogeography, v. 48, n. 12, . (15/02853-6, 16/20055-2, 16/24464-4, 09/16009-1)
ABREU, EDSON FIEDLER; DALAPICOLLA, JERONYMO; FURINI, PAULO ROBERTO; DE LA SANCHA, NOE U.; JANSA, SHARON A.; PERCEQUILLO, ALEXANDRE REIS. Habitat stability shaped the demographic history of the Atlantic Forest endemic rodent Euryoryzomys russatus (Cricetidae: Sigmodontinae) during the Pleistocene. Biological Journal of the Linnean Society, v. N/A, p. 16-pg., . (16/24464-4, 15/02853-6, 12/15928-6, 09/16009-1)
DALAPICOLLA, JERONYMO; ABREU, EDSON FIEDLER; DO PRADO, JOYCE RODRIGUES; CHIQUITO, ELISANDRA DE ALMEIDA; DE OLIVEIRA ROTH, PAULO RICARDO; DE GOES BRENNAND, PAMELLA GUSMAO; D'OLIVEIRA PAVAN, ANA CAROLINA; PEREIRA, ALEX; MENDES, FABIANA ROCHA; DEL VALLE ALVAREZ, MARTIN ROBERTO; et al. reas of endemism of small mammals are underprotected in the Atlantic Fores. JOURNAL OF MAMMALOGY, v. 102, n. 5, p. 1390-1404, . (10/14633-7, 16/24464-4, 16/20055-2, 13/25441-0, 14/01986-0, 14/18800-6, 15/02853-6, 12/15928-6)