Estudo de associação genômica ampla (GWAS) para características de carcaça de tilápias Oreochromis sp

Resumo

Análises de Associação Genômica Ampla (GWAS) serão realizadas em uma população de Tilápias com objetivo de verificar a associação entre marcadores SNP's e características corporais de importância econômica. 1900 animais da variedade de Tilápia Supra®, provenientes do programa de melhoramento genético conduzido pelo Grupo ACI S.A (Cañas - Costa Rica), serão fenotipados (peso corporal e rendimento de filé) e genotipados. O DNA genômico será extraído de amostras da nadadeira caudal dos peixes e a genotipagem será realizada utilizando um painel de 50k SNP's em desenvolvimento por pesquisadores da Aquainnovo e Universidad de Chile juntamente com a empresa Affymetrix. A qualidade da genotipagem será testada considerando o índice de Desequilíbrio de Hardy-Weinberg, Menor Frequência Alélica e taxa de genotipagem. O nível de desequilíbrio de ligação (r2) será calculado para verificar a capacidade dos marcadores de registrar a variação fenotípica da característica analisada. As análises GWAS seguirão um modelo linear misto considerando os efeitos fixos, efeito genético aditivo aleatório individual e o efeito aleatório do marcador genético. Os valores utilizados para verificar a associação significativa entre os marcadores SNPs e as características avaliadas serão corrigido pelo método de Bonferroni. A proporção da herdabilidade e da variância fenotípica explicada pelos marcadores serão estimadas. O efeito aproximado de cada marcador SNP será estimado por regressão linear. (AU)