Análise de genes envolvidos em um QTL para brix em espécies Saccarum

Resumo

A cana-de-açúcar é utilizada para produção de biocombustíveis e açúcar em todo o mundo. As cultivares modernas são originadas de dois genomas diferentes, o Saccharum officinarum e o S. spontaneum, com diferentes números de cromossomos. Este processo permitiu que a transmissão cromossômica se desse de forma assimétrica, resultando em variedades com diferentes números cromossômicos nas células somáticas, geralmente com 100 a 130 cromossomos. A condição aneuploidia e alta ploidia fazem da cana-de-açúcar a espécie cultivada de maior complexidade genética.O uso de ferramentas da biologia molecular tem aumentado à compreensão da relevância da arquitetura do genoma da cana-de-açúcar. É essencial conhecer a posição e o comportamento dos genes que controlam as características com interesse econômico. Uma maneira de obter essa informação é através do sequenciamento do genoma inteiro. Porém, em cana-de-açúcar a reconstrução da sequência presente dentro de um cromossomo é um grande desafio devido à grande quantidade de elementos repetitivos espalhados no genoma. Assim, durante o desenvolvimento de nosso projeto Postdoc (Fapesp 2014 / 11482-9), propusemos utilizar a alta sintenia entre sorgo e cana-de-açúcar para escolher um QTL específico descrito em sorgo ligado ao Brix e explorar esta região em cana-de-açúcar. Os resultados preliminares desta pesquisa mostraram a formação de blocos sintênicos. Agora, nossa principal intenção será avaliar a arquitetura do genoma em uma região específica e conhecer a origem dos genes envolvidos para tal característica. Para as análises envolvendo a evolução do genoma, propusemos uma colaboração com o grupo do Dr. Ray Ming para explorar os principais genes responsáveis pelo acumulo de sacarose bem como o mecanismo associado a esta complexa característica. Assim, este projeto tem como objetivo estudar os genes envolvidos em um QTL para Brix, a fim de conhecer suas origens, comparando com transcritos de espécies do gênero Saccharum.