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Identificação de genes de co-expressão em tecido muscular de bovinos Nelore divergente para fenótipos de marmoreio e índice de fragmentação miofibrilar, usando dados de RNA-Seq

Processo: 18/11154-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 03 de setembro de 2018
Data de Término da vigência: 30 de agosto de 2019
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Lucia Galvão de Albuquerque
Beneficiário:Maria Malane Magalhães Muniz
Supervisor: Angela Canovas
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Guelph, Canadá  
Vinculado à bolsa:17/04270-3 - Estudo do transcriptoma de tecido muscular de bovinos da raça nelore divergentes para qualidade de carne, BP.DR
Assunto(s):Gado Nelore   Transcriptômica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Co-expressão | Marmoreio | Mfi | Nelore | RNA- seq | transcriptomica

Resumo

As características da qualidade da carne são de difícil mensuração e raramente contempladas em programas de melhoramento. No entanto, devido a grande importância econômica dessas características, é crescente a busca de conhecimento sobre os fatores e mecanismos moleculares que controlam a expressão das mesmas. Este projeto tem como objetivo avaliar a coexpressão diferencial de genes em tecido muscular de animais Nelore, machos não castrados, extremos para índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e marmorização, utilizando dados de transcritos obtidos por RNA-Seq. A partir deste conhecimento, espera-se que seja possível associar a expressão de isoformas e a coexpressão gênica diferencial entre os grupos divergentes, fato que produzirá um melhor entendimento sobre os mecanismos moleculares envolvidos.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MAGALHAES MUNIZ, MARIA MALANE; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; FERRO, JESUS APARECIDO; LOYOLA CHARDULO, LUIZ ARTUR; BALDI, FERNANDO; CANOVAS, ANGELA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Small genetic variation affecting mRNA isoforms associated with marbling and meat color in beef cattle. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS, v. N/A, p. 16-pg., . (09/16118-5, 17/10630-2, 18/11154-2, 11/21241-0, 18/20026-8)
MAGALHAES MUNIZ, MARIA MALANE; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; DE OLIVEIRA, HINAYAH ROJAS; BALDI, FERNANDO; CHARDULO, ARTUR LOYOLA; FERRO, JESUS APARECIDO; CANOVAS, ANGELA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Identification of novel mRNA isoforms associated with meat tenderness using RNA sequencing data in beef cattle. MEAT SCIENCE, v. 173, . (18/20026-8, 11/21241-0, 18/11154-2, 09/16118-5, 17/10630-2)
MAGALHAES MUNIZ, MARIA MALANE; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; BECKER SCALEZ, DAIANE CRISTINA; VEGA, AROA SUAREZ; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; FERRO, JESUS APARECIDO; CHARDULO, ARTUR LOYOLA; BALDI, FERNANDO; CANOVAS, ANGELA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Characterization of novel lncRNA muscle expression profiles associated with meat quality in beef cattle. EVOLUTIONARY APPLICATIONS, v. 15, n. 4, p. 13-pg., . (18/11154-2, 18/20026-8, 09/16118-5, 17/10630-2, 11/21241-0)
MUNIZ, MALANE M.; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; CANOVAS, ANGELA; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; FERRO, JESUS APARECIDO; CHARDULO, ARTUR LOYOLA; BALDI, FERNANDO; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Structural variants affecting mRNAs isoforms splice sites associated with marbling in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 98, p. 2-pg., . (18/11154-2, 11/21241-0, 09/16118-5, 18/20026-8, 17/10630-2)