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Estudos estruturais acerca do trocador de Na+/Ca2+ (CALX) por espectroscopia de ressonância magnética nuclear em solução

Processo:19/19968-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2020
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Roberto Kopke Salinas
Beneficiário:Roberto Kopke Salinas
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Auxílio(s) vinculado(s):21/10218-0 - Uma visão molecular da dinâmica entre os domínios de CALX-CBD12 a partir de simulações de dinâmica molecular, RDCs, e SAXS, PUB.ART
Bolsa(s) vinculada(s):21/10013-9 - Caracterização biofísica do domínio CBD12 do trocador CALX1.2, BP.TT
21/00636-9 - Assinalamento das ressonâncias da cadeia principal de CALX-CBD12 nos estados Apo e Holo, BP.TT
Assunto(s):Biologia estrutural  Espectroscopia de ressonância magnética nuclear  Proteínas  Trocador de sódio e cálcio  Drosophila melanogaster  Archaea  Regulação alostérica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia Estrutural | Ca2+ | RMN de proteínas | Trocador de Na+ | RMN de proteínas

Resumo

Trocadores de Na+/Ca2+ (NCX) são proteínas da membrana plasmática que utilizam o gradiente eletroquímico do Na+ para remover Ca2+ do citosol. Eles são essenciais para a manutenção da homeostase de Ca2+ intracelular em diferentes tipos de células, particularmente em células excitáveis. CALX, o trocador de Na+/Ca2+ de Drosophila melanogaster, é encontrado em células sensoriais. Além de transportar Na+ e Ca2+, os trocadores NCX são regulados por estes íons. A regulação alostérica do CALX por Ca2+ é singular, uma vez que este trocador é inibido ao invés de ser ativado pela ligação de Ca2+ ao domínio sensor intracelular. O objetivo desta proposta é investigar a estrutura do CALX, e o mecanismo de regulação alostérica deste trocador. Como se trata de uma proteína de membrana, que combina domínios globulares com segmentos intrinsecamente desordenados, a abordagem utilizada será o estudo de fragmentos do trocador produzidos de forma recombinante. Nós vamos utilizar espectroscopia de RMN em solução como técnica principal. Os objetivos específicos são: i) estudar a estrutura e a funcionalidade do NCX da archaea Methanococcus janaschii (NCX-Mj) isolado na presença de detergentes; ii) investigar em detalhes atômicos o mecanismo de regulação alostérica do CALX por Ca2+ intracelular. Para atingir o último objetivo vamos estudar fragmentos do CALX por uma combinação de medidas de RMN em solução e calorimetria (ITC). Além disso vamos investigar a funcionalidade do CALX in célula utilizando medidas de imageamento de Ca2+. (AU)

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Publicações científicas
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
DE SOUZA DEGENHARDT, MAXIMILIA F.; VITALE, PHELIPE A. M.; ABIKO, LAYARA A.; ZACHARIAS, MARTIN; SATTLER, MICHAEL; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; SALINAS, ROBERTO K.. Molecular insights on CALX-CBD12 interdomain dynamics from MD simulations, RDCs, and SAXS. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 120, n. 17, p. 3664-3675, . (18/16092-5, 16/24531-3, 19/19968-1, 17/05614-8, 16/07490-1)
SALINAS, ROBERTO KOPKE. The application of solution NMR spectroscopy to study dynamics of two-domain calcium-binding proteins. JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE OPEN, v. 16-17, p. 10-pg., . (19/19968-1)
AQUINO, GIOVANA PARREIRA DE; GOMES, MARCO ANTONIO MENDES; SALINAS, ROBERTO KOPKE; LARANJEIRA-SILVA, MARIA FERNANDA. Lipid and fatty acid metabolism in trypanosomatids. MICROBIAL CELL, v. 8, n. 11, p. 262-275, . (18/15971-5, 19/19968-1)