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Caracterização estrutural de proteínas de ligação a RNA e varredura de bibliotecas de fragmentos químicos por LC-MS cromatografia líquida integrada com espectrometria de massas

Processo: 20/16094-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2021
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2023
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Acordo de Cooperação: Agilent
Pesquisador responsável:Katlin Brauer Massirer
Beneficiário:Lucas Rodrigo de Souza
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Empresa:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)
Vinculado ao auxílio:20/02006-0 - Caracterização molecular e estrutural de proteínas de ligação a RNA como alvos terapêuticos em câncer e neurologia, AP.PITE
Assunto(s):Biologia estrutural   Espectrometria de massas   Proteínas de ligação a RNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia Estrutural | Espectrometria de massas | Proteínas de ligação a RNA | rastremento de fragmentos químicos | Biologia de RNA

Resumo

Com o objetivo de expandir o proteoma que apresente potencial terapêutico para conduzir à descoberta de novos medicamentos, trabalhamos na caracterização de proteínas humanas não estudadas, que mostram conexão preliminar à doença. Dentro deste objetivo, estudamos a importância das proteínas de regulação de RNA como alvos de anticorpos e drogas, incluindo as proteínas 'per se' e seus moduladores como quinases e metiltranferases. Assim, as proteínas de ligação ao RNA e as proteínas quinase constituem importantes alvos biológicos para o avanço da biofarma. Essas proteínas podem ser reguladas por sondas químicas de pequenas moléculas, que são moléculas com alta afinidade e seletividade para um alvo e que podem entrar na célula para engajar o alvo in vivo. As sondas funcionam como um complemento para reagentes biológicos na validação de alvos e podem ser refinadas para se tornarem novas drogas. Além disso, alvos biológicos também podem levar à imunoterapia. Neste projeto, pretendemos contribuir para a caracterização das proteínas de ligação a RNA BICC (Bicaudal C Homology 1) e UHMK (motivo homológico U2AF Serine / Threonine-Protein kinase) como alvos potenciais de drogas relacionadas ao câncer e neurologia. Iremos caracterizar seus interagentes, o conjunto de mRNA-alvo e procurar novos ligantes químicos. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TAKARADA, JESSICA E.; CUNHA, MICAEL R.; ALMEIDA, VITOR M.; VASCONCELOS, STANLEY N. S.; SANTIAGO, ANDRE S.; GODOI, PAULO H.; SALMAZO, ANITA; RAMOS, PRISCILA Z.; FALA, ANGELA M.; DE SOUZA, LUCAS R.; et al. Discovery of pyrazolo[3,4-d]pyrimidines as novel mitogen-activated protein kinase kinase 3 (MKK3) inhibitors. Bioorganic & Medicinal Chemistry, v. 98, p. 13-pg., . (21/04853-4, 14/50897-0, 22/00743-2, 20/16094-8, 18/09475-5)
DE SOUZA, LUCAS RODRIGO; POLY DA SILVA, ITALO ESPOSTI; CELIS-SILVA, GABRIELE; RADDATZ, BRUNA WINKERT; IMAMURA, LOUISE MATIE; KIM, EDSON YU SIN; VALDERRAMA, GABRIEL VIEIRA; RIEDI, HALANNA DE PAULA; ROGAL JR, SERGIO RENATO; MACHADO DE ALMEIDA, BERNARDO MONTESANTI; et al. Improved protocol for Bst polymerase and reverse transcriptase production and application to a point-of-care diagnostics system. Experimental Biology and Medicine, v. 248, n. 19, p. 13-pg., . (20/16094-8, 20/02006-0, 14/50897-0, 19/11320-2)