Mapeamento de assinaturas epigenômicas de células-tronco tumorais em gliomas: correlacionando células-tronco de gliomas com dados clínicos e moleculares

Resumo

Este pesquisador trabalhará na identificação de assinaturas epigenômicas de células-tronco que possam predizer a agressividade tumoral e identificar regiões genômicas regulatórias associados ao stemness em amostras de glioma. Para isso serão utilizados dados públicos e ferramentas R/biocondutor de código aberto para mapear assinaturas de células-tronco neurais não tumorais e células-tronco tumorais de gliomas, que podem ser usadas para medir o estado de desdiferenciação (Stemness) de amostras de glioma em relação à sua célula de origem. Adicionalmente, iremos catalogar asalterações epigenéticas presentes em tumores com propriedades de células-tronco. Serão definidas assinaturas de metilação do DNA de células tronco neurais não tumorais e células tronco tumorais de glioma, utilizando-as na construção de um modelo de predição (por Aprendizado de Máquinas) de Stemness. Em seguida. Em seguida, o modelo de predição será aplicado em amostras de glioma do banco de dado público Atlas do Genoma do Câncer (TCGA) e outros repositórios públicos para a quantificação do Stemness nos tumores. A identificação de amostras de glioma com assinaturas de células-tronco contribuirá para o entendimento da gliomagênese, célula de origem e agressividade dos gliomas. (AU)