Aplicação da tecnologia portátil de sequenciamento minion para a análise do metagenoma viral

Resumo

As tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (SNG) têm crescido aceleradamente nos últimos anos, permitindo, assim, a geração maciça de dados genômicos de forma simultânea, imparcial e rápida. Uma das principais aplicações do SNG é a metagenômica, que contribui para identificação de agentes patogênicos emergentes e assinaturas genômicas, transformando assim a medicina. Embora a principal plataforma mundial de obtenção de dados metagenômicos seja representada pela marca Illumina, este equipamento tem alto custo, exige recursos humanos capacitados e necessita de infraestrutura altamente sofisticada. Diante desse cenário, uma técnica que vem ganhando espaço no campo científico é a plataforma portátil MinION, que apresenta baixo custo, não necessita de infraestrutura aprimorada e, portanto, pode ser utilizada para estudos de campo em regiões remotas que na maioria dos casos são afetadas pelos surtos emergentes. No entanto, a plataforma MinION tem sido raramente aplicada para estudos metagenômicos devido à falta de adequada padronização tanto para o processo de obtenção de metagenoma, como os passos de pré-preparação de amostras, concentração viral e extração. Dessa maneira, o objetivo deste projeto é padronizar a tecnologia MinION com a finalidade de obter e analisar o metaviroma de doadores de sangue de três regiões brasileiras: Sudeste (São Paulo), Centro-Oeste (Distrito Federal) e a região amazônica (Amapá), previamente infectados com agentes virais como HBV, HIV e HCV. Os resultados deste estudo permitirão além de ter informação sobre a composição do viroma dos doadores brasileiros de alto risco, também irão possibilitar a aplicação da tecnologia MinION na área de metagenômica viral e vigilância epidemiológica molecular. (AU)