| Processo: | 22/00910-6 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Iniciação Científica |
| Data de Início da vigência: | 01 de março de 2022 |
| Data de Término da vigência: | 31 de dezembro de 2022 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | Svetoslav Nanev Slavov |
| Beneficiário: | Gabriel Montenegro de Campos |
| Instituição Sede: | Hemocentro de Ribeirão Preto. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (HCMRP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 17/23205-8 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas, AP.JP |
| Assunto(s): | Biologia computacional Genética molecular Filogenia Metagenômica |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Classificação taxonômica | Diversidade viral | Metagenômica viral | Montagem de Genomas | Pipelines | Virus Emergentes | Virologia Clínica |
Resumo Os métodos metagenômicos são uma das ferramentas mais sensíveis para identificação de vírus emergentes. Com o advento das tecnologias de sequenciamento de última geração, a diversidade do software que é utilizado para a análise dos dados tem crescido significativamente. A análise bioinformática dos dados de sequenciamento de última geração ainda apresenta um desafio para interpretação correta dos dados obtidos devido a variabilidade dos programas utilizados para classificação taxonômica. Portanto, este Projeto tem como objetivo desenvolver e padronizar uma pipeline para metanálise de vírus a partir de dados de sequenciamento obtidos de diversas amostras clínicas (plasma de pacientes com câncer de próstata, doenças febris não identificadas e catadores de lixo). Ao mesmo tempo, serão conduzidas em paralelo comparações com outros programas de bioinformática e principalmente classificadores taxonômicos virais. Concomitantemente serão feitos ajustes nos banco de dados dos classificadores uma vez que eles apresentam alta variabilidade dos dados taxonômicos virais disponíveis. Feito isso, será feita a montagem dos vírus identificados com importância clínica e os mesmos serão submetidos a análise filogenética com o intuito de investigar a epidemiologia molecular dos mesmos. Esse projeto permitirá a ter uma visão mais profunda no metaviroma de diversos grupos de pacientes. | |
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