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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Molecular evolution of HoxA13 and the multiple origins of limbless morphologies in amphibians and reptiles

Texto completo
Autor(es):
Singarete, Marina E. [1] ; Grizante, Mariana B. [2, 3] ; Milograna, Sarah R. [3] ; Nery, Mariana F. [4, 3] ; Kin, Koryu [5] ; Wagner, Guenter P. [5, 6] ; Kohlsdorf, Tiana [3]
Número total de Autores: 7
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Programa Posgrad Biol Celular & Mol, Dept Biol Celular & Mol & Bioagentes Patogen, Fac Med Ribeirao Preto, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil
[2] Arizona State Univ, Sch Life Sci, Tempe, AZ - USA
[3] Univ Sao Paulo, Dept Biol, Fac Filosofia Ciencias & Letras Ribeirao Preto, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil
[4] Univ Estadual Campinas, Dept Genet Evolucao & Bioagentes, Campinas, SP - Brazil
[5] Yale Univ, Dept Ecol & Evolutionary Biol, New Haven, CT - USA
[6] Yale Univ, Dept Obstet Gynecol & Reprod Sci, Yale Syst Biol Inst, West Haven, CT - USA
Número total de Afiliações: 6
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY; v. 38, n. 3, p. 255-262, 2015.
Citações Web of Science: 3
Resumo

Developmental processes and their results, morphological characters, are inherited through transmission of genes regulating development. While there is ample evidence that cis-regulatory elements tend to be modular, with sequence segments dedicated to different roles, the situation for proteins is less clear, being particularly complex for transcription factors with multiple functions. Some motifs mediating protein-protein interactions may be exclusive to particular developmental roles, but it is also possible that motifs are mostly shared among different processes. Here we focus on HoxA13, a protein essential for limb development. We asked whether the HoxA13 amino acid sequence evolved similarly in three limbless clades: Gymnophiona, Amphisbaenia and Serpentes. We explored variation in omega (dN/dS) using a maximum-likelihood framework and HoxA13 sequences from 47 species. Comparisons of evolutionary models provided low omega global values and no evidence that HoxA13 experienced relaxed selection in limbless clades. Branch-site models failed to detect evidence for positive selection acting on any site along branches of Amphisbaena and Gymnophiona, while three sites were identified in Serpentes. Examination of alignments did not reveal consistent sequence differences between limbed and limbless species. We conclude that HoxA13 has no modules exclusive to limb development, which may be explained by its involvement in multiple developmental processes. (AU)

Processo FAPESP: 10/52316-3 - Mecanismos de desenvolvimento embrionário e evolução da diversidade fenotípica em tetrápodes basais
Beneficiário:Tiana Kohlsdorf
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
Processo FAPESP: 12/13165-5 - Associações entre a evolução molecular dos genes HOX e a evolução da diversidade morfológica em Squamata e Marsupialia
Beneficiário:Sarah Ribeiro Milograna
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 10/00447-7 - Evolução de morfologias convergentes em Squamata: módulos de desenvolvimento e padrões de alongamento corporal
Beneficiário:Mariana Bortoletto Grizante
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 11/18868-1 - Evolução de diversidade merística e morfométrica no Autopódio de Squamata: padrões, processos e mecanismos
Beneficiário:Tiana Kohlsdorf
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular