| Texto completo | |
| Autor(es): Mostrar menos - |
Cantor, Mauricio
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Pires, Mathias M.
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Marquitti, Flavia M. D.
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Raimundo, Rafael L. G.
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Sebastian-Gonzalez, Esther
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Coltri, Patricia P.
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Perez, S. Ivan
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Barneche, Diego R.
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Brandt, Debora Y. C.
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Nunes, Kelly
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Daura-Jorge, Fabio G.
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Floeter, Sergio R.
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Guimaraes, Jr., Paulo R.
Número total de Autores: 13
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | PLoS One; v. 12, n. 2 FEB 6 2017. |
| Citações Web of Science: | 12 |
| Resumo | |
Biological networks pervade nature. They describe systems throughout all levels of biological organization, from molecules regulating metabolism to species interactions that shape ecosystem dynamics. The network thinking revealed recurrent organizational patterns in complex biological systems, such as the formation of semi-independent groups of connected elements (modularity) and non-random distributions of interactions among elements. Other structural patterns, such as nestedness, have been primarily assessed in ecological networks formed by two non-overlapping sets of elements; information on its occurrence on other levels of organization is lacking. Nestedness occurs when interactions of less connected elements form proper subsets of the interactions of more connected elements. Only recently these properties began to be appreciated in one-mode networks (where all elements can interact) which describe a much wider variety of biological phenomena. Here, we compute nestedness in a diverse collection of one-mode networked systems from six different levels of biological organization depicting gene and protein interactions, complex phenotypes, animal societies, metapopulations, food webs and vertebrate metacommunities. Our findings suggest that nestedness emerge independently of interaction type or biological scale and reveal that disparate systems can share nested organization features characterized by inclusive subsets of interacting elements with decreasing connectedness. We primarily explore the implications of a nested structure for each of these studied systems, then theorize on how nested networks are assembled. We hypothesize that nestedness emerges across scales due to processes that, although system-dependent, may share a general compromise between two features: specificity (the number of interactions the elements of the system can have) and affinity (how these elements can be connected to each other). Our findings suggesting occurrence of nestedness throughout biological scales can stimulate the debate on how pervasive nestedness may be in nature, while the theoretical emergent principles can aid further research on commonalities of biological networks. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 15/11985-3 - Evolução da cooperação entre diferentes espécies |
| Beneficiário: | Flávia Maria Darcie Marquitti |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 14/21106-4 - Divergência fenotípica e especiação ecológica em mutualismos: efeitos da estrutura espacial e intimidade de interação |
| Beneficiário: | Rafael Luís Galdini Raimundo |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 11/11346-0 - Parasitas de interações e a coevolução de mutualismos |
| Beneficiário: | Flávia Maria Darcie Marquitti |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Processo FAPESP: | 11/13054-6 - A seleção natural e a estrutura, dinâmica e diversificação de assembleias de espécies mutualistas |
| Beneficiário: | Rafael Luís Galdini Raimundo |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Processo FAPESP: | 13/02738-7 - Caracterização do papel de proteínas reguladoras do splicing em eucariotos |
| Beneficiário: | Patricia Pereira Coltri |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Processo FAPESP: | 13/22016-6 - Os efeitos da imigração sobre a dinâmica da diversificação de mamíferos na América do Norte |
| Beneficiário: | Mathias Mistretta Pires |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 09/54422-8 - Estrutura e dinâmica coevolutiva em redes de interações mutualísticas |
| Beneficiário: | Paulo Roberto Guimarães Junior |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores |
| Processo FAPESP: | 12/09950-9 - Evolução de genes HLA: diferenciação populacional e sinais de seleção recente em populações nativas e miscigenadas do Brasil |
| Beneficiário: | Kelly Nunes |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |