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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Large-scale molecular phylogeny, morphology, divergence-time estimation, and the fossil record of advanced caenophidian snakes (Squamata: Serpentes)

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Autor(es):
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Zaher, Hussam [1, 2] ; Murphy, Robert W. [3, 4] ; Arredondo, Juan Camilo [1] ; Graboski, Roberta [5, 1] ; Machado-Filho, Paulo Roberto [1] ; Mahlow, Kristin [6] ; Montingellil, Giovanna G. [1] ; Quadros, Ana Bottallo [1, 2] ; Orlov, Nikolai L. [7] ; Wilkinson, Mark [8] ; Zhang, Ya-Ping [4, 9] ; Grazziotin, Felipe G. [10]
Número total de Autores: 12
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Museu Zool, Sao Paulo, SP - Brazil
[2] Sorbonne Univ, Museum Natl Hist Nat, Ctr Rech Paleontol CR2P, Paris - France
[3] Royal Ontario Museum, Ctr Biodivers, Toronto, ON - Canada
[4] Kunming Inst Zool, State Key Lab Genet Resources & Evolut, Kunming, Yunnan - Peoples R China
[5] Museu Paraense Emilio Goeldi, Lab Herpetol, Belem, Para - Brazil
[6] Leibniz Inst Evolut & Biodivers Sci, Museum Nat Kunde, Berlin - Germany
[7] Russian Acad Sci, Zool Inst, St Petersburg - Russia
[8] Nat Hist Museum, Dept Life Sci, London - England
[9] Yunnan Univ, Lab Conservat & Utilizat Bioresources, Kunming, Yunnan - Peoples R China
[10] Inst Butantan, Lab Colecoes Zool, Sao Paulo, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 10
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: PLoS One; v. 14, n. 5 MAY 10 2019.
Citações Web of Science: 1
Resumo

Caenophidian snakes include the file snake genus Acrochordus and advanced colubroidean snakes that radiated mainly during the Neogene. Although caenophidian snakes are a well-supported clade, their inferred affinities, based either on molecular or morphological data, remain poorly known or controversial. Here, we provide an expanded molecular phylogenetic analysis of Caenophidia and use three non-parametric measures of support-Shimodaira-Hasegawa-Like test (SHL), Felsentein (FBP) and transfer (TBE) bootstrap measures-to evaluate the robustness of each clade in the molecular tree. That very different alternative support values are common suggests that results based on only one support value should be viewed with caution. Using a scheme to combine support values, we find 20.9% of the 1265 clades comprising the inferred caenophidian tree are unambiguously supported by both SHL and FBP values, while almost 37% are unsupported or ambiguously supported, revealing the substantial extent of phylogenetic problems within Caenophidia. Combined FBP/TBE support values show similar results, while SHL/TBE result in slightly higher combined values. We consider key morphological attributes of colubroidean cranial, vertebral and hemipenial anatomy and provide additional morphological evidence supporting the clades Colubroides, Colubriformes, and Endoglyptodonta. We review and revise the relevant caenophidian fossil record and provide a time-calibrated tree derived from our molecular data to discuss the main cladogenetic events that resulted in present-day patterns of caenophidian diversification. Our results suggest that all extant families of Colubroidea and Elapoidea composing the present-day endoglyptodont fauna originated rapidly within the early Oligocene-between approximately 33 and 28 Mya-following the major terrestrial faunal turnover known as the ``Grande Coupure{''} and associated with the overall climate shift at the Eocene-Oligocene boundary. Our results further suggest that the caenophidian radiation originated within the Caenozoic, with the divergence between Colubroides and Acrochordidae occurring in the early Eocene, at similar to 56 Mya. (AU)

Processo FAPESP: 07/52781-5 - Filogenia molecular da subfamília Xenodontinae (sensu lato): a irradiação de serpentes colubrídeas do Novo Mundo (Serpentes, Colubroidea, Colubridae)
Beneficiário:Felipe Gobbi Grazziotin
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 08/52285-0 - Filogeografia de typhlops brongersmianus (serpentes: scolecophidia: typhlopidae): padrões de diversidade genética em uma serpente fossorial
Beneficiário:Roberta Graboski Mendes
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 02/13602-4 - Evolução da fauna de répteis no sudeste brasileiro do Cretáceo superior ao recente: paleontologia, filogenia e biogeografia
Beneficiário:Hussam El Dine Zaher
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Processo FAPESP: 12/08661-3 - Genômica comparada de serpentes insulares
Beneficiário:Felipe Gobbi Grazziotin
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 12/24755-8 - Análise filogenética e evolução das formas da cabeça de Amphisbaenia (Reptilia, Squamata)
Beneficiário:Roberta Graboski Mendes
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 16/13469-5 - Desenvolvimento de infraestrutura, ferramentas de análise e integração de dados de genômica e transcriptômica no projeto CeTICS
Beneficiário:Felipe Gobbi Grazziotin
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Processo FAPESP: 07/52144-5 - Análise da variação longitudinal do esqueleto axial em serpentes (Squamata) empregando ferramentas de morfometria geométrica
Beneficiário:Fábio de Andrade Machado
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 16/50127-5 - Dimensions US-BIOTA São Paulo: scales of biodiversity: integrated studies of snake venom evolution and function across multiple levels of diversity
Beneficiário:Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Processo FAPESP: 11/50206-9 - Origem e evolução das serpentes e a sua diversificação na região neotropical: uma abordagem multidisciplinar
Beneficiário:Hussam El Dine Zaher
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático