| Texto completo | |
| Autor(es): |
Crestana, Gustavo Schiavone
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Taniguti, Lucas Mitsuo
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dos Santos, Clesivan Pereira
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Benevenuto, Juliana
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Ceresini, Paulo Cezar
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Carvalho, Giselle
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Kitajima, Joao Paulo
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Monteiro-Vitorello, Claudia Barros
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Número total de Autores: 8
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| Afiliação do(s) autor(es): | [1] Univ Sao Paulo, Dept Genet, Genom Grp, Luiz de Queiroz Coll Agr, USP ESALQ, BR-13418900 Piracicaba, SP - Brazil
[2] Mendel Anal Genom SA, BR-04013000 Sao Paulo, SP - Brazil
[3] Sao Paulo State Univ UNESP, Plant Hlth Rural Engn & Soils Dept, Mol Phytopathol Lab, BR-15385000 Ilha Solteira, SP - Brazil
[4] SENAI Innovat Inst Biomass, BR-79640250 Tres Lagoas, MS - Brazil
Número total de Afiliações: 4
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS; v. 34, n. 4, p. 448-452, APR 2021. |
| Citações Web of Science: | 0 |
| Resumo | |
Here, we present the first complete chromosome-level genome assembly of the smut fungus strain Sporisorium panici-leucophaei SPL10A, the causal agent of the sourgrass (Digitaria insularis) smut disease. Combining Illumina paired-end and Nanopore long reads, we generated a final assembly composed of 23 chromosomes (22 nuclear and one mitochondrial) with 18,915,934 bp. Gene prediction accomplished using extrinsic evidence from the sugarcane smut fungus Sporisorium scitamineum originated a total of 6,402 protein-encoding genes. The secretome (388 proteins) and the effectorome repertoires (68 candidates) were also predicted, given their crucial roles in plant-pathogen interactions. The complete telomere-to-telomere chromosome sequences of this poorly studied fungus will provide a valuable resource for future comparative genomic studies among smuts to unravel their underlying pathogenicity mechanisms. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 18/24028-5 - Estudos sobre interação Sporisorium panici-leucophaei e Digitaria insularis |
| Beneficiário: | Gustavo Schiavone Crestana |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Processo FAPESP: | 17/13268-2 - Estudos genômicos e funcionais da interação Sporisorium scitamineum-cana e de outros fungos causadores do carvão: avanços e desafios |
| Beneficiário: | Claudia Barros Monteiro Vitorello |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Processo FAPESP: | 16/17545-8 - Contribuição de genes, genomas e elementos de transposição na interação entre plantas e micro-organismos: estudo de caso em cana-de-açúcar |
| Beneficiário: | Marie-Anne Van Sluys |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático |