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(Referência obtida automaticamente do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

The order of events on Avian coronavirus life cycle shapes the order of quasispecies evolution during host switches

Texto completo
Autor(es):
Paulo E. Brandão [1] ; Mikael Berg [2] ; Beatriz A. Leite [3] ; Sheila O.S. Silva [4] ; Sueli A. Taniwaki [5]
Número total de Autores: 5
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - Brasil
[2] Swedish University of Agricultural Sciences. Department of Biomedical Sciences and Veterinary Public Health,. Section of Virology - Suécia
[3] Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - Brasil
[4] Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - Brasil
[5] Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - Brasil
Número total de Afiliações: 5
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY; v. 45, n. 2 2022-06-06.
Resumo

Abstract To understand the population genetics events during coronavirus host switches, the Beaudette strain of Avian coronavirus (AvCoV) adapted to BHK-21 cells was passaged 15 times in VERO cells, the virus load and the variants at each passage being determined by RT-qPCR and genome-length deep sequencing. From BHK-21 P2 to VERO P3, a trend for the extinction of variants was followed by stability up to VERO P11 and both the emergence and the rise in frequency in some variants, while the virus loads were stable up to VERO P12. At the spillover from BHK-21 to VERO cells, variants that both emerged, showed a rise in frequency or were extinguished were detected on the spike, while variants at the M gene showed the same pattern only at VERO passage 13. Furthermore, nsps 3-5, 9 and 15 variants were detected at lower passages compared to the consensus sequences, with those at nsp3 being detected in the spectra also at higher passages. This suggests that quasispecies coronavirus evolution in spillovers follows the virus life cycle, starting with the evolution of the receptor binding proteins, followed by the replicase and then proteins involved in virion assembly, keeping the general fitness of the mutant spectrum stable. (AU)

Processo FAPESP: 18/12417-7 - Evolução experimental em quase-espécies com coronavírus aviário
Beneficiário:Paulo Eduardo Brandão
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular