The art of vector engineering: towards the construction of next-generation genetic tools

Autor(es)

Nora, Luisa Czamanski ; Westmann, Caua Antunes ; Martins-Santana, Leonardo ; Alves, Luana de Fatima ; Oliveira Monteiro, Lummy Maria ; Guazzaroni, Maria-Eugenia ; Silva-Rocha, Rafael

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: MICROBIAL BIOTECHNOLOGY; v. 12, n. 1, p. 23-pg., 2019-01-01.

Resumo

When recombinant DNA technology was developed more than 40 years ago, no one could have imagined the impact it would have on both society and the scientific community. In the field of genetic engineering, the most important tool developed was the plasmid vector. This technology has been continuously expanding and undergoing adaptations. Here, we provide a detailed view following the evolution of vectors built throughout the years destined to study microorganisms and their peculiarities, including those whose genomes can only be revealed through metagenomics. We remark how synthetic biology became a turning point in designing these genetic tools to create meaningful innovations. We have placed special focus on the tools for engineering bacteria and fungi (both yeast and filamentous fungi) and those available to construct metagenomic libraries. Based on this overview, future goals would include the development of modular vectors bearing standardized parts and orthogonally designed circuits, a task not fully addressed thus far. Finally, we present some challenges that should be overcome to enable the next generation of vector design and ways to address it. (AU)

• Processo FAPESP: 16/05472-6 - Engenharia e prospecção de novos elementos regulatórios em bactéria através de abordagens de biologia sintética
• Beneficiário: Cauã Antunes Westmann
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 16/06323-4 - Novas ferramentas para abordagens metagenômicas na prospecção de celulases
• Beneficiário: Luana de Fátima Alves
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 17/17924-1 - Construção de promotores sintéticos para expressão de celulases usando novos elementos cis-regulatórios em Trichoderma reesei
• Beneficiário: Leonardo Martins Santana
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 16/19179-9 - Desvendando as relações arquitetura/função de promotores bacterianos complexos utilizando abordagens de biologia sintética
• Beneficiário: Lummy Maria Oliveira Monteiro
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 16/03763-3 - Desvendando os mecanismos de regulação gênica a nível de células únicas em Trichoderma reesei
• Beneficiário: Luísa Czamanski Nora
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 12/22921-8 - Abordagens de biologia sintética para decifrar os mecanismos de integração de sinais em promotores bacterianos complexos
• Beneficiário: Rafael Silva Rocha
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas
• Beneficiário: María Eugenia Guazzaroni
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores